24 lag (de nasjonale nasjonale mesterne i de beste ligaene, og et variabelt antall andre klubber fra de viktigste nasjonale nasjonale ligaene). Konkurransen kulminerte med en Final Four.
Lagfordeling
Landets rangering
For EuroLeague 1999–2000 tildeles landene plasser i henhold til deres plassering på FIBA -landets rangeringer, som tar hensyn til deres prestasjoner i europeiske konkurranser fra 1996–97 til 1998–99.
FIBA: I Euroleague mister lag som nummer 6 i andre etappe 1998–99 FIBA EuroLeague (gruppe EH) en plass for landet sitt i neste sesong. Disse båtplassene er oppnådd av landene hvis lag kommer til semifinalerunden i FIBA Saporta Cup 1998–99 . Som hovedregel kan et forbund ikke ha mer enn 3 lag i Euroleague. Skulle en semifinalist i Saporta Cup skaffe en køye til for landet sitt, i tilfelle den allerede har 3 køyer tildelt i Euroleague, vil denne køya bli overført til neste forbund i FIBA Ranking som har 2 lag (så lenge et av sine lag nådde 1/4 siste runde i Saporta Cup i løpet av samme sesong) ..
Lag
Etikettene i parentes viser hvordan hvert lag kvalifiserte seg til stedet for startrunden: