Geotrichum candidum -Geotrichum candidum

Geotrichum candidum
Geotrichum candidum
Geotrichum candidum
Vitenskapelig klassifisering redigere
Kongedømme: Sopp
Inndeling: Ascomycota
Klasse: Saccharomycetes
Rekkefølge: Saccharomycetales
Familie: Dipodascaceae
Slekt: Geotrichum
Arter:
G. candidum
Binomisk navn
Geotrichum candidum
Lenke (1809)
Synonymer
  • Galactomyces candidus

Geotrichum candidum er en sopp som er et medlem av det humane mikrobiomet , spesielt assosiert med hud, sputum og avføring der det forekommer i 25–30% av prøvene. Det er vanlig i jord og har blitt isolert fra jord samlet rundt om i verden, på alle kontinenter.

G. candidum er årsaken til geotrichose hos mennesker , plantesykdommen sur råte som infiserer sitrusfrukter , tomater , gulrøtter og andre grønnsaker. Det kan påvirke høstet frukter av durians som Durio graveolens .

G. candidum brukes mye i produksjonen av visse meieriprodukter, inkludert skallost som Camembert , Saint-Nectaire , Reblochon og andre. Soppen kan også bli funnet i et nordisk yoghurt -lignende produkt som kalles viili hvor det er ansvarlig for produktets fløyelsaktig tekstur.

I en studie fra 2001 ble det funnet at G. candidum konsumerte polykarbonatet som finnes på CD -plater . Denne effekten er imidlertid ikke gjengitt.

Historie

Taksonomi

Slekten Geotrichum ble beskrevet av Johann Heinrich Friedrich Link i 1809 for å imøtekomme arten G. candidum som finnes på råtnende blader. Siden den gang har over 130 taxa blitt beskrevet i slekten, og hundrevis av synonymer har blitt generert. For eksempel ble G. candidum feilklassifisert som Oidium lactis i mye tidlig litteratur. Arter av Geotrichum ligner slektene Trichosporon og Protendomycopsis ; imidlertid, Geotrichum er av ascomycetous tilknytning mens de sistnevnte er medlemmer av stilksporesopper . Arter av Geotrichum blir tidvis forvekslet med raskt voksende medlemmer av slekten Dipodascus , som er preget av uregelmessig forgrenede, 10–14 μm brede hyfer og produksjon av enkelsporer asci . I motsetning til Geotrichum mangler imidlertid medlemmer av slekten Dipodascus dikotom forgrening av de perifere hyfene, og deres veksthastigheter er generelt mindre enn 3 mm per dag.

Filogeni

Galactomyces candidus , tidligere antatt å være en distinkt takson, ble funnet å være den seksuelle tilstanden til G. candidum ved bruk av sekvensbaserte metoder Geotrichum candidum i vid forstand består av 3 klader , tilsvarende artene G. candidum , G. clavatum og G . fici , som alle antas å ha et patogent potensial. Arter av Geotrichum kan differensieres ved sekvensanalyse av den store nukleare ribosomale underenheten ( 18S ribosomal RNA ) eller den interne transkriberte avstandsdelen av det nukleære ribosomale RNA -genet.

Morfologi

Anamorph

G. candidum kolonier er tynne, spredte, myke, kremete og hvite i anamorf tilstand. Soppen G. candidum er preget av hyfer som ser krypende ut, for det meste nedsenket og septatee . Hyfenes farge ser ut til å være hyalin eller lett pigmentert. Når hyfer blir luftbårne, endrer den form fra artroconidia til sylindrisk eller fatformet eller ellipsoidal. Chlamydosporene er subglobose, ensom, båret på udifferensierte hyfer. Blastoconidia utvikler seg noen ganger på hyfer lateralt. Conidia fremstår artrosporøs, terminal eller intercalary, antenne på en agaroverflate. De conidia størrelsesområdet fra 4,8 til 12,5 um x 2,4-2,5 um.

Teleomorph

G. candidum antas å være homothallisk, men de fleste isolater er selvsterile. Seksuell reproduksjon ble først observert i stammer isolert fra jord i Puerto Rico . Soppen produserer globose asci som inneholder en enkel, tykkvegget, ikke -kjernet , globos til oval askospor som måler 6-7 μm med 7-10 μm. Askosporene har en glatt innervegg og en furet yttervegg. Septaene er perforert av mikrosporer , arrangert i en ringstruktur. Det ser ut til at koloniene vokser raskere i seksuell fase enn det aseksuelle stadiet. Kolonier vokser med en hastighet på 5-7 mm daglig ved 24 ° C (75 ° F).

Vekst

Geotrichum candidum danner en raskt voksende koloni som kan vokse til 5-6 cm i diameter på 5 dager på Sabouraud-glukoseagar , wortagar og syntetiske medier. Mikroskopisk er veksten preget av produksjon av dikotomt forgrenede hyfer som ligner stemmegafler langs kolonimarginen. Kondialkjedene blir antenne, oppreist eller decumbent og måler 6–12 (−20) x 3–6 (−9) μm. Soppen kan vokse på en rekke sitrusfrukter og forårsake surrot. Det har en tendens til å forårsake råte i frukt som er lagret ved 0–5 ° C (32–41 ° F). Conidia er fargeløse og har et slimaktig belegg. G. candidum finnes også av og til i menneskets tarm, avføring , sputum og på huden. Soppen vokser i jord, vann, kloakk, forskjellige plantesubstrater, bakerdeig, gjæringsskall, brød, melk og melkeprodukter Den optimale temperaturen for vekst er 25 ° C (77 ° F) med et pH -område på 5,0–5,5. Temperaturområdet endres avhengig av overflaten som soppen vokser på. For eksempel varierer den optimale temperaturen i planter fra 25–27 ° C (77–81 ° F). Hos dyr varierer den optimale temperaturen fra 30–31 ° C (86–88 ° F). Maksimal temperatur for vekst er 35–38 ° C (95–100 ° F). Soppvekst kan understøttes av D-glukose , D-mannose , D-xylose , L-sorbose , D-fruktose , D-galaktose , sukrose , D-mannitol , D-sorbital , etanol og glyserol . Sporulering krever ofte en balanse mellom karbon og nitrogen.

Fordeling

G. candidum er ekstremt vanlig i jord og har blitt isolert fra underlag i Canada , USA , Storbritannia , Tyskland , Østerrike , India , Sør -Afrika , Japan , Brasil og Peru . Det finnes også som et årsaksmiddel i sur råte i sitrusfrukter - en myk råte forbundet med utslipp av en fruktig lukt. Soppen er også kjent som et ødeleggelsesmiddel etter høst av muskmelon, squash og agurk. Den spiller en rolle i tomatfruktråte når den lagres ved 0–5 ° C (32–41 ° F).

Det er en naturlig forekommende kolonist av visse meieriprodukter, spesielt oster, og blir en gang brukt til å vaksinere ost med vaskeskall og oppblåst hud .

Kommersiell bruk

G. candidum kan brukes kommersielt for å vaksinere vaske- og oppblåsbare oster. Kulturer kan tilsettes melk, saltlake eller sprøytes på ostens overflate. Det optimale pH -området for vekst på ost varierer fra 4,4 til 6,7. Soppen koloniserer nesten hele ostens overflate i de tidlige stadiene av modning. Den finnes på myke oster som Camembert-ost og halvhard ost Saint-Nectaire og Reblochon. For Camembert -osten vokser soppen på utsiden av osten og danner en skall. Soppen er ansvarlig for den ensartede, hvite, fløyelsaktige pelsen på Saint-Marcellin- ost. Lipaser og proteaser fra G. candidum frigjør fettsyrer og peptider som gir osten særegne smaker. G. candidum reduserer bitterheten i Camembert -ost gjennom aktiviteten til aminopeptidasene som hydrolyserer hydrofobe peptider med lav molekylvekt. Aminopeptidaser bidrar også til en aroma i tradisjonelle Norman Camembert. Soppen nøytraliserer også ostemassen ved å nedbryte melkesyre produsert av bakterier. G. candidum forbereder osten for kolonisering av andre syrefølsomme bakterier som Brevibacterium . Soppen hemmer veksten av bakteriene Listeria monocytogenes . Kommersielle stammer av G. candidum er tilgjengelige for modning av ost.

Se også

Referanser

Pahwa, S; Kaur, S; Jain, R; Roy, N (2010). "Strukturbasert design av nye hemmere for histidinol dehydrogenase fra Geotrichum candidum". Bioorg Med Chem Lett . 20 (13): 3972–6. doi : 10.1016/j.bmcl.2010.04.116 . PMID  20488699 .

Videre lesning

  • Domsch, KH, W. Gams og TH Anderson (1980) Compendium of Soil Fungi Volume 1, Academic Press, London, UK

Eksterne linker