Mycobacterium africanum -Mycobacterium africanum
| Mycobacterium africanum | |
|---|---|
| Vitenskapelig klassifisering | |
| Domene: | |
| Filum: |
" Actinobacteria "
|
| Klasse: | |
| Rekkefølge: | |
| Familie: | |
| Slekt: | |
| Arter: |
M. africanum
|
| Binomisk navn | |
|
Mycobacterium africanum Castets et al. 1969, ATCC 25420
|
|
Mycobacterium africanum er en art av Mycobacterium som oftest finnes i vestafrikanske land, hvor det anslås å forårsake opptil 40% av lungetuberkulose. Symptomene på infeksjon ligner symptomer på M. tuberculosis .
Det er medlem av Mycobacterium tuberculosis -komplekset .
Taksonomi
Det er syv store avstamninger i Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC), med avstamninger 5 og 6 klassifisert som Mycobacterium africanum . MTBC -avstamning 5 er M. africanum type 1, West African 1 (MAF1), og er klassifisert basert på en karakteristisk sletting av Region of Differentiation (RD) 711. MAF1 finnes ofte rundt Guineabukta. MTBC avstamning 6 er også kjent som M. africanum type 1, West African 2 (MAF2), og er klassifisert basert på en sletting av RD702. MAF2 er utbredt i Vest -Afrika. M. africanum type 2, østafrikansk, ble tidligere anerkjent som en stamme av Mycobacterium africanum ; den ble nylig omklassifisert som Mycobacterium tuberculosis genotype “Uganda” i en sublineage av MTBC -avstamning 4.
Historie
M. africanum ble først beskrevet som en underart innen MTBC, med fenotypiske egenskaper mellom M. tuberculosis og M. bovis , basert på biokjemisk testing av Castets i 1968. Tidlig genetisk analyse viste at den var forskjellig fra M. tuberculosis på grunn av en genomisk RD9 -sletting og distinkt GyrB -nukleotidsekvens , og forskjellig fra M. bovis på grunn av en intakt RD12 og RD4.
Mikrobiologi
M. africanum dyrkes i pyruvatholdige medier under lave oksygenforhold, og danner karakteristiske "dysgoniske" kolonier. I motsetning til M. tuberculosis , viser M. africanum katalaseaktivitet, er nitratnegativ og er utsatt for tiopen-2-karboksylsyrehydrazid (TCH) og pyrazinamid (PZA). M. africanum vokser også langsommere enn M. tuberculosis , vanligvis tar det 10 uker å utvikle kolonier i stedet for 3 til 4 for M. tuberculosis .
Epidemiologi
M. africanum finnes oftest i vestafrikanske land. Det er bare en infeksjon av mennesker og spres via en luftbåren rute fra personer med åpne sykdomstilfeller.
Det er ikke helt forstått hvorfor fordelingen av M. africanum er begrenset til Vest -Afrika, med bare sporadiske tilfeller funnet i andre regioner. Fylogenetiske bevis viser at M. africanum på et tidlig stadium forgrenet seg fra moderne Mtb -stammer i Amerika, Europa og Asia. Noen undersøkelser tyder på at M. africanum er tilpasset vestafrikanske populasjoner. M. africanum kan bli utkonkurrert av andre Mtb -linjer i andre regioner; Imidlertid har genetiske studier ikke funnet noen forskjell i antall virulensgener eller genetisk mangfold mellom M. tuberculosis og M. africanum . Ingen dyrreservoar er identifisert for Mycobacterium africanum til tross for at de har blitt funnet forskjellige ville dyr.
Den har en lignende grad av smittsomhet som den vanlige M. tuberculosis -organismen, men det er mindre sannsynlig at den utvikler seg til klinisk sykdom hos et immunkompetent individ. Imidlertid er M. africanum mer sannsynlig å utvikle seg fra infeksjon til å forårsake sykdom hos en HIV -positiv pasient. I land der M. africanum er endemisk, representerer det en viktig opportunistisk infeksjon i de senere stadiene av HIV -sykdom.
Patogenese
Det er ikke fullt ut forstått hvordan de genetiske forskjellene mellom M. africanum og M. tuberculosis gir opphav til den lavere patogeniteten til førstnevnte. Imidlertid er det kjent at Region of Difference 9 (RD9) mangler hos M. africanum, men finnes i M. tuberculosis .
M. africanum har også bemerkelsesverdige forskjeller i lipidkatabolisme og metabolisme. I tillegg er virulensveier som dosR/Rv0081 regulon eller ESAT-6 regulering forstyrret i M. africanum .
Behandling
På grunn av lignende symptomer og forskjellige vekstforhold mellom Mycobacterium tuberculosis og africanum , er kulturmetoder upålitelige for diagnose. Molekylærbiologisk genotyping har forbedret identifikasjonen. Spesielt "spoligotyping" eller "spacer oligonucleotide typing" er en rask polymerasekjedereaksjonsbasert metode for genotyping av stammer i MTBC. Nylig har hurtige tester for lateral flyt blitt utviklet basert på mpt64 -antigenet som finnes i alle medlemmer av MTBC.
M. africanum har en lavere progresjonshastighet fra latens til aktiv sykdom enn M. tuberculosis . M. africanum tuberculosis behandles med et identisk regime som tuberkulose forårsaket av M. tuberculosis . Den generelle kurshastigheten er lik, men ettersom flere M. africanum- pasienter sannsynligvis vil være HIV-positive, kan de ha høyere dødelighet av annen HIV-relatert sykdom.
Type belastning
ATCC 25420 = CIP 105147
Referanser
Bibliografi
- Skerman, VBD; McGowan, V .; Sneath, PHA (januar 1980). "Godkjente lister over bakterielle navn" . Int. J. Syst. Bakteriol . 30 (1): 225–420. doi : 10.1099/00207713-30-1-225 .