Nitrogenoksydreduktase - Nitrous-oxide reductase
lystgassreduktase | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatorer | |||||||||
EF-nr. | 1.7.2.4 | ||||||||
CAS-nr. | 55576-44-8 | ||||||||
Databaser | |||||||||
IntEnz | IntEnz-visning | ||||||||
BRENDA | BRENDA-oppføring | ||||||||
EXPASy | Fin utsikt over utsikten | ||||||||
KEGG | KEGG-oppføring | ||||||||
MetaCyc | metabolsk vei | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
FBF- strukturer | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
I enzymologi , en dinitrogenoksid reduktase også kjent som nitrogen: akseptor oksidoreduktase (N 2 O dannende) er et enzym som katalyserer det siste trinn i bakterie denitrifisering , reduksjon av nitrogenoksid til dinitrogentetroksyd .
- N 2 O + 2 redusert cytokom c ⇌ N 2 + H 2 O + 2 cytokrom c
Det spiller en avgjørende rolle for å forhindre utslipp av en potent klimagass i atmosfæren.
Funksjon
N 2 O er et uorganisk metabolitt av den prokaryote cellen under denitrifikasjon. Således omfatter denitrifieringsmidler hovedgruppen av N 2 O-produsenter, med roller også spilt av nitrifieringsmidler, metanotrofe bakterier og sopp . Blant dem har bare denitrifiserende prokaryoter muligheten til å konvertere N 2 O til N 2 . Omdannelse av N- 2 O i N 2 er det siste trinn i en fullstendig nitrat denitrifikasjonsprosess og er en autonom form for respirasjon. N 2 O genereres i den denitrifiserende celle av aktiviteten av respiratorisk NO reduktase . Noen mikrobesamfunn bare har evnen til N 2 O reduksjon til N- 2 og har ikke de andre denitrifikasjonsproses trasé slike miljøer er kjent som lystgass reduksjonsgir. Noen denitrifieringsmidler har ikke fullstendig denitrifisering med sluttprodukt N 2 O
Struktur
Nitrogenoksydreduktase er en homodimer som er lokalisert i bakteriell periplasma. Røntgenstrukturer av enzymene fra Pseudomonas nautica og Paracoccus denitrificans har avslørt at hver underenhet (MW = 65 kDa) er organisert i to domener. En cupredoxin-lignende domene inneholder en binuclear kobber protein kjent som Cu A .
Det andre domene består av et 7-bladet propell av p-ark som inneholder det katalytiske sete kalt Cu Z , som er et tetranuclear kobber-sulfid klynge . Avstanden mellom Cu A og Cu Z- sentrene i en enkelt underenhet er større enn 30 Å, en avstand som utelukker fysiologisk relevante hastigheter for elektronoverføring innen underenhet . Imidlertid er de to underenhetene orientert "fra hode til hale" slik at Cu A- senteret i en underenhet bare ligger 10 Å fra Cu Z- senteret i det andre, slik at par av redoks-sentre i motsatte underenheter danner den katalytisk kompetente enheten. Cu A senter kan gjennomgå en ett-elektron redoks- endring og følgelig har en funksjon tilsvarende den som i den kjente aa 3 -type cytokrom c oksidase ( EC 1.9.3.1 ), hvor det tjener til å oppta et elektron fra løselig cytokrom c .
Inhibitorer
Acetylen er den mest spesifikke hemmeren av dinitrogenoksydreduktase . Andre inhibitorer inkluderer azidanion , tiocyanat , karbonmonoksid , jodid og cyanid .