Peptid - Peptide
Peptider (fra gresk πεπτός, peptós "fordøyd"; avledet fra πέσσειν, péssein "å fordøye") er korte kjeder av aminosyrer forbundet med peptidbindinger . Kjeder med færre enn ti eller femten aminosyrer kalles oligopeptider , og inkluderer dipeptider , tripeptider og tetrapeptider .
Et polypeptid er en lengre, kontinuerlig, uforgrenet peptidkjede. Derfor faller peptider under de brede kjemiske klassene av biologiske polymerer og oligomerer , sammen med nukleinsyrer , oligosakkarider , polysakkarider og andre.
Et polypeptid som inneholder mer enn omtrent femti aminosyrer er kjent som et protein . Proteiner består av ett eller flere polypeptider ordnet på en biologisk funksjonell måte, ofte bundet til ligander som koenzymer og kofaktorer , eller til et annet protein eller annet makromolekyl som DNA eller RNA , eller til komplekse makromolekylære sammenstillinger .
Aminosyrer som er inkorporert i peptider kalles rester . Et vannmolekyl frigjøres under dannelsen av hver amidbinding . Alle peptider unntatt sykliske peptider har en N-terminal (amingruppe) og C-terminal (karboksylgruppe) rest ved enden av peptidet (som vist for tetrapeptidet på bildet).
Klasser
Mange typer peptider er kjent. De har blitt klassifisert eller kategorisert i henhold til deres kilder og funksjoner. I følge Handbook of Biologically Active Peptides, inkluderer noen grupper av peptider plantepeptider, bakterielle/ antibiotiske peptider , sopppeptider, virvelløse peptider, amfibier/hudpeptider, giftpeptider, kreft/kreftpeptider, vaksinepeptider, immun-/inflammatoriske peptider, hjerne peptider, endokrine peptider , inntakspeptider, gastrointestinale peptider, kardiovaskulære peptider , nyrepeptider, respiratoriske peptider, opiatpeptider , nevrotrofiske peptider og blod -hjerne -peptider .
Noen ribosomale peptider er utsatt for proteolyse . Disse fungerer, vanligvis i høyere organismer, som hormoner og signalmolekyler. Noen organismer produserer peptider som antibiotika , for eksempel mikrociner og bakteriociner .
Peptider har ofte posttranslasjonelle modifikasjoner som fosforylering , hydroksylering , sulfonering , palmitoylering , glykosylering og disulfiddannelse . Generelt er peptider lineære, selv om lariatstrukturer har blitt observert. Mer eksotiske manipulasjoner forekommer, for eksempel racemisering av L-aminosyrer til D-aminosyrer i gift av platypus .
Nonribosomale peptider samles av enzymer , ikke ribosomet. Et vanlig ikke-ribosomalt peptid er glutation , en komponent i antioksidantforsvaret til de fleste aerobe organismer. Andre ikke -ribosomale peptider er mest vanlige i encellede organismer , planter og sopp og syntetiseres av modulære enzymkomplekser kalt nonribosomale peptidsyntetaser .
Disse kompleksene er ofte lagt opp på en lignende måte, og de kan inneholde mange forskjellige moduler for å utføre et mangfoldig sett med kjemiske manipulasjoner på det utviklende produktet. Disse peptidene er ofte sykliske og kan ha svært komplekse sykliske strukturer, selv om lineære ikke -ribosomale peptider også er vanlige. Siden systemet er nært knyttet til maskineriet for å bygge fettsyrer og polyketider , blir hybride forbindelser ofte funnet. Nærværet av oksazoler eller tiazoler ofte indikerer at forbindelsen ble syntetisert på denne måte.
Peptoner er avledet fra animalsk melk eller kjøtt fordøyd ved proteolyse . I tillegg til å inneholde små peptider, inneholder det resulterende materialet fett, metaller, salter, vitaminer og mange andre biologiske forbindelser. Peptoner brukes i næringsmedier for dyrking av bakterier og sopp.
Peptidfragmenter refererer til fragmenter av proteiner som brukes til å identifisere eller kvantifisere kildeproteinet. Ofte er dette produktene av enzymatisk nedbrytning utført i laboratoriet på en kontrollert prøve, men kan også være rettsmedisinske eller paleontologiske prøver som har blitt degradert av naturlige effekter.
Kjemisk syntese
Eksempler på familier
Peptidfamiliene i denne seksjonen er ribosomale peptider, vanligvis med hormonell aktivitet. Alle disse peptidene syntetiseres av celler som lengre "propeptider" eller "proproteiner" og avkortes før de forlater cellen. De slippes ut i blodet der de utfører sine signalfunksjoner.
Antimikrobielle peptider
- Familien Magainin
- Cecropin -familien
- Cathelicidin -familien
- Defensin -familien
Takykininpeptider
Vasoaktive tarmpeptider
- VIP ( V asoactive I nestestinal P eptide ; PHM27)
- PACAP P ituitary A denylate C yclase A ctivating P eptide
- Peptid PHI 27 ( P eptide H istidine I soleucine 27 )
- GHRH 1-24 ( G rekke H ormone R eleasing H ormone 1-24)
- Glukagon
- Secretin
- NPY ( N euro P eptide Y )
- PYY ( P eptide YY )
- APP ( A vian P ancreatic P olypeptide)
- PPY P ancreatic P ol Y peptid
Opioide peptider
- Proopiomelanokortin (POMC) peptider
- Enkephalin pentapeptider
- prodynorfin peptider
Kalsitoninpeptider
Selvmonterende peptider
- Aromatiske korte peptider
- Biomimetiske peptider
- Peptid amfifiler
- Peptid dendrimerer
Andre peptider
- B -type natriuretisk peptid (BNP) - produsert i myokardiet og nyttig i medisinsk diagnose
- Laktotripeptider - Laktotripeptider kan redusere blodtrykket , selv om bevisene er blandet.
- Peptidiske komponenter fra tradisjonell kinesisk medisin Colla Corii Asini i hematopoiesis.
Terminologi
Lengde
Flere begreper knyttet til peptider har ingen strenge lengdefinisjoner, og det er ofte overlapping i bruken av dem.
- Et polypeptid er en enkelt lineær kjede av mange aminosyrer (hvilken som helst lengde), holdt sammen av amidbindinger .
- Et protein består av ett eller flere polypeptider (mer enn omtrent 50 aminosyrer lange).
- Et oligopeptid består av bare noen få aminosyrer (mellom to og tjue).
Antall aminosyrer
Peptider med definert lengde navngis ved hjelp av IUPAC numeriske multiplikatorprefikser .
- Et monopeptid har en aminosyre.
- Et dipeptid har to aminosyrer.
- Et tripeptid har tre aminosyrer.
- Et tetrapeptid har fire aminosyrer.
- Et pentapeptid har fem aminosyrer.
- Et heksapeptid har seks aminosyrer.
- Et heptapeptid har syv aminosyrer.
- Et oktapeptid har åtte aminosyrer ( f.eks . Angiotensin II ).
- Et nonapeptid har ni aminosyrer ( f.eks . Oksytocin ).
- Et dekapeptid har ti aminosyrer ( f.eks . Gonadotropinfrigivende hormon og angiotensin I ).
Funksjon
- Et nevropeptid er et peptid som er aktivt i forbindelse med nevralvev.
- Et lipopeptid er et peptid som har et lipid koblet til det, og pepduciner er lipopeptider som interagerer med GPCR.
- Et peptidhormon er et peptid som fungerer som et hormon .
- En proteose er en blanding av peptider produsert ved hydrolyse av proteiner. Begrepet er noe arkaisk.
- Et peptidergisk middel (eller stoff) er et kjemikalie som fungerer for å direkte modulere peptidsystemene i kroppen eller hjernen. Et eksempel er opioidergika , som er neuropeptidergika .
- Celleinntrengende peptid er et peptid som er i stand til å trenge inn i cellemembranen.
Se også
- Acetylheksapeptid-3
- Beefy kjøttfullt peptid
- Kollagen hybridiserer peptid , et kort peptid som kan binde seg til denaturert kollagen i vev
- Bis-peptid
- CLE -peptid
- Epidermal vekstfaktor
- Journal of Peptide Science
- Laktotripeptider
- Mikropeptid
- Multifunksjonelt peptid
- Neuropeptid
- Palmitoyl pentapeptid-4
- Bukspyttkjertelhormon
- peptid spektralbibliotek
- Peptidsyntese
- Peptidomimetika (for eksempel peptoider og β-peptider ) til peptider, men med forskjellige egenskaper.
- Protein -kode , som beskriver tillegg av peptidsekvenser for å muliggjøre proteinisolering eller -deteksjon
- Replikiner
- Ribosom
- Oversettelse (biologi)
Referanser