Etter hans eldre bror Ptolemaios XIII i Egypt 13. januar 47 f.Kr., og i henhold til hans vilje ble han utropt til farao og medhersker av deres eldre søster og gjenværende farao , Cleopatra VII i Egypt . Han var omtrent 12 år gammel da han tiltrådte tronen. Han og hans eldre søster, Cleopatra, var gift, men Cleopatra fortsatte å fungere som elsker av den romerske diktatoren Julius Caesar . Ptolemaios anses bare å ha regjert i navn, som en innrømmelse for egyptisk tradisjon, med Cleopatra som beholder faktisk autoritet.
15. mars 44 f.Kr. ble Caesar myrdet i Roma av en gruppe konspiratorer hvis mest bemerkelsesverdige medlemmer var Marcus Junius Brutus og Gaius Cassius Longinus . Ptolemaios fulgte ham snart i døden. En inskripsjon som omtalte ham som levende, ble datert 26. juli 44 f.Kr. Det har blitt antatt, men er fortsatt usikkert at Cleopatra forgiftet hennes medhersker, med akonitt , for å erstatte ham med nevøen Ptolemaios XV Caesar , hennes sønn av Caesar som ble utropt til medhersker 2. september 44 f.Kr. og som moren hadde til hensikt å støtte som hans etterfølger.
