Varianter av SARS-CoV-2- Variants of SARS-CoV-2

Positive, negative og nøytrale mutasjoner under utviklingen av koronavirus som SARS-CoV-2

Alvorlig akutt respiratorisk syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), viruset som forårsaker koronavirussykdom 2019 (COVID-19), har mange varianter ; noen antas, eller har blitt antatt, å være av spesiell betydning på grunn av deres potensial for økt overførbarhet, økt virulens eller redusert effektivitet av vaksiner mot dem.

Oversikt

Fremveksten av SARS-CoV-2 kan ha resultert fra rekombinasjonshendelser mellom et flaggermus SARS-lignende koronavirus og et pangolin- koronavirus gjennom kryssoverføring.

De tidligste tilgjengelige humane virusgenomene ble samlet inn fra pasienter siden desember 2019, og kinesiske forskere sammenlignet disse tidlige genomene med flaggermus- og pangolin -koronavirusstammer for å estimere den forfedre menneskelige koronavirustypen; den identifiserte forfedert genomet ble merket "S", og den dominerende avledede typen ble merket "L" for å gjenspeile de mutante aminosyreendringene. Uavhengig utførte vestlige forskere lignende analyser, men merket forfedertypen "A" og den avledede typen "B". B-typen muterte til ytterligere typer, inkludert til B.1, som er stamfar til de store globale varianter av bekymring, merket i 2021 av WHO som alfa, beta, gamma og delta.

Tidlig i pandemien var det få 'mutante' variantvirus på grunn av det lille antallet infiserte mennesker (dvs. det var færre muligheter for fluktmutanter å dukke opp). Etter hvert som tiden gikk begynte SARS-CoV-2 å utvikle seg for å bli mer overførbar. Spesielt er Alpha -varianten og Delta -varianten begge mer overførbare enn det opprinnelige viruset identifisert rundt Wuhan i Kina.

SARS-CoV-2 bekymringsvarianter er i stand til å mutere slik at de kan fortsette å spre seg mot økende befolkningsimmunitet, samtidig som de opprettholder replikasjonskvaliteten.

Tabellen nedenfor viser informasjon og relativt risikonivå for bekymringsvarianter (VOC). Intervallene forutsetter 95% tillit eller troverdighet , med mindre annet er angitt. For øyeblikket er alle estimater omtrentlige på grunn av begrenset tilgjengelighet av data for studier. For Alpha, Beta, Gamma og Delta er det ingen endring i testnøyaktigheten , og nøytraliserende antistoffaktivitet beholdes av noen monoklonale antistoffer.

Identifikasjon Fremveksten Endringer i forhold til tidligere varianter i sirkulasjon på tidspunktet og stedet for fremveksten Nøytraliserende antistoffaktivitet (eller effekt når tilgjengelig)
WHO -etikett PANGO slekt PHE -variant Nextstrain clade Første utbrudd Tidligste prøve Utpekt VOC Bemerkelsesverdige mutasjoner Overførbarhet Sykehusinnleggelse Dødelighet Fra naturlig infeksjon Fra vaksinasjon
Alpha B.1.1.7 VOC -20DEC -01 20I (V1) Storbritannia 20. september 2020 18. desember 2020 69–70del, N501Y, P681H +29% ( 24 -33% ) +52% (47 -57% ) +59% (44 -74% )
CFR 0,06% for aldersgruppen <50, 4,8% for aldersgruppen> 50
Minimal reduksjon Minimal reduksjon
B.1.1.7 med E484K VOC -21FEB -02 26. januar 2021 5. februar 2021 E484K, 69–70del, N501Y, P681H Betydelig redusert Betydelig redusert
Beta B.1.351 VOC -20DEC -02 20H (V2) Sør-Afrika Mai 2020 14. januar 2021 K417N, E484K, N501Y +25% (20 -30% ) Under etterforskning Muligens økt Redusert T -cellersvar fremkalt av D614G -virus er fortsatt effektivt Effekt: redusert mot symptomatisk sykdom, beholdt mot alvorlig sykdom
Gamma S.1 VOC -21JAN -02 20J (V3) Brasil November 2020 15. januar 2021 K417T, E484K, N501Y +38% (29 -48% ) Muligens økt +50% (50% CrI ,20 -90% ) Redusert Beholdt av mange
Delta B.1.617 .2 VOC -21APR -02 21A India Oktober 2020 6. mai 2021 L452R, T478K, P681R +97% (76 -117% ) +85% (39 -147% ) i forhold til Alpha +137% (50 -230% )
CFR 0,04% for <50 aldersgruppe uvaksinert, 6,5% for> 50 aldersgruppe uvaksinert
Reinfeksjoner skjedde, med mindre forekomst enn vaksinerte infeksjoner Effektreduksjon for ikke-alvorlig sykdom

  Svært høy risiko   Høy risiko   Middels risiko   Lav risiko   Ukjent risiko

Nomenklatur

SARS-CoV-2 tilsvarende nomenklaturer
PANGO -avstamninger Notater til PANGO -stammer Nextstrain clades, 2021 GISAID klader Bemerkelsesverdige varianter
A.1 – A.6 19B S Inneholder "referansesekvens" WIV04/2019
B.3 – B.7 , B.9 , B.10 , B.13 – B.16 19A L
O
B.2 V
B.1 B.1.5 – B.1.72 20A G Avstamning B.1 i nomenklatursystemet PANGO Lineages; inkluderer Delta/ B.1.617
B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37 GH
B.1.3 – B.1.66 20C Inkluderer Epsilon/ B.1.427/ B.1.429/ CAL.20C og Eta/ B.1.525
20G Overveiende i USA generelt, februar 21
20H Inkluderer Beta/ B.1.351 aka 20H/ 501Y.V2 eller 501.V2 avstamning
B.1.1 20B GR Inkluderer B.1.1.207
20D
20J Inkluderer Gamma/ P.1 og Zeta/ P.2
20F
20I Inkluderer Alpha/ B.1.1.7 aka VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 eller 20I/501Y.V1
B.1.177 20E (EU1) GV Avledet fra 20A
Trediagram over avstamninger til SARS-CoV-2 i henhold til Pango-nomenklatursystemet.

SARS-CoV-2-varianter er klassifisert i henhold til deres slekt og komponentmutasjoner, men fra juli 2021 er det ikke etablert noen konsekvent nomenklatur for den. Mange organisasjoner, inkludert regjeringer og nyhetssteder, refererer i daglig tale til varianter fra landet der de først ble identifisert. Etter måneder med diskusjoner kunngjorde Verdens helseorganisasjon navn på greske bokstaver for viktige stammer 31. mai 2021, slik at de lett kunne refereres til på en enkel, lett å si og ikke-stigmatiserende måte. Denne beslutningen kan delvis ha blitt tatt på grunn av kritikk fra regjeringer om bruk av landnavn for å referere til varianter av viruset.

Ulike SARS-CoV-2-varianter som offisielt rapporteres av CDC, NIH, i forhold til mutasjoner L452R og E484K

Selv om det er mange tusen varianter av SARS-CoV-2, kan undertyper av viruset settes inn i større grupper som for eksempel slektninger eller klader . Tre hoved, generelt brukte nomenklaturer er blitt foreslått:

  • Fra januar 2021 hadde GISAID- referert til SARS-CoV-2 som hCoV-19-identifisert åtte globale klader (S, O, L, V, G, GH, GR og GV).
  • I 2017 hadde Hadfield et al. kunngjorde Nextstrain , beregnet "for sporing av patogenutvikling i sanntid". Nextstrain har senere blitt brukt til å spore SARS-CoV-2, og identifiserte 13 store klader (19A – B, 20A – 20J og 21A) fra juni 2021.
  • I 2020 ble Rambaut et al. av programvareteamet Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN) som i en artikkel foreslo "en dynamisk nomenklatur for SARS-CoV-2-linjer som fokuserer på aktivt sirkulerende viruslinjer og de som sprer seg til nye steder"; fra august 2021 hadde 1340 avstamninger blitt utpekt.

Hvert nasjonalt folkehelseinstitutt kan også innføre sitt eget nomenklatursystem for å spore bestemte varianter. For eksempel angav Public Health England hver sporede variant etter år, måned og nummer i formatet [ÅÅÅÅ] [MM]/[NN], og prefikset "VUI" eller "VOC" for henholdsvis en variant som er under utredning eller en variant av bekymring . Dette systemet er nå endret og bruker nå formatet [YY] [MMM]-[NN], der måneden skrives ut ved hjelp av en kode på tre bokstaver.

Referansesekvens

Siden det foreløpig ikke er kjent når indeksfallet eller 'pasientnull' skjedde, er valg av referansesekvens for en gitt studie relativt vilkårlig, med forskjellige bemerkelsesverdige forskningsstudiers valg som varierer som følger:

  • Den tidligste sekvensen, Wuhan-1 , ble samlet inn 24. desember 2019.
  • En gruppe (Sudhir Kumar et al.) Refererer mye til et NCBI -referansegenom (GenBankID: NC_045512; GISAID ID: EPI_ISL_402125), denne prøven ble samlet 26. desember 2019, selv om de også brukte WIV04 GISAID -referansegenomet (ID: EPI_ISL_402124) , i sine analyser.
  • Ifølge en annen kilde (Zhukova et al.) Antas sekvensen WIV04 / 2019 , som tilhører GISAID S -kladen / PANGO A -linjen / Nextstrain 19B -kladen , nærmest gjenspeile sekvensen til det opprinnelige viruset som infiserer mennesker - kjent som " sekvens null ". WIV04/2019 ble tatt fra en symptomatisk pasient 30. desember 2019 og er mye brukt (spesielt av de som samarbeider med GISAID) som en referansesekvens .

Varianten ble først prøvetatt og identifisert i Wuhan, Kina, anses av forskere for å skille seg fra stamgenomet med tre mutasjoner. Deretter har mange forskjellige linjer til SARS-CoV-2 utviklet seg.

Kriterier for merkbarhet

Virus skaffer seg vanligvis mutasjoner over tid, noe som gir opphav til nye varianter. Når en ny variant ser ut til å vokse i en populasjon, kan den merkes som en "fremvoksende variant". Når det gjelder SARS-CoV-2, skiller nye avstamninger seg ofte fra hverandre med bare noen få nukleotider.

Noen av de potensielle konsekvensene av nye varianter er følgende:

  • Økt overførbarhet
  • Økt sykelighet
  • Økt dødelighet
  • Evne til å unngå påvisning ved diagnostiske tester
  • Nedsatt følsomhet for antivirale legemidler (hvis og når slike legemidler er tilgjengelige)
  • Nedsatt følsomhet for nøytraliserende antistoffer, enten terapeutiske (f.eks. Rekonvalescerende plasma eller monoklonale antistoffer) eller i laboratorieforsøk
  • Evne til å unngå naturlig immunitet (f.eks. Forårsaker reinfeksjoner)
  • Evne til å infisere vaksinerte personer
  • Økt risiko for spesielle tilstander som multisystem inflammatorisk syndrom eller lang COVID .
  • Økt affinitet for bestemte demografiske eller kliniske grupper, for eksempel barn eller immunkompromitterte personer.

Varianter som ser ut til å oppfylle ett eller flere av disse kriteriene, kan bli merket med "varianter under utredning" eller "varianter av interesse" i påvente av bekreftelse og validering av disse egenskapene. Den primære egenskapen til en variant av interesse er at den viser bevis som viser at den er årsaken til en økt andel tilfeller eller unike utbruddsklynger; den må imidlertid også ha begrenset utbredelse eller ekspansjon på nasjonalt nivå, ellers vil klassifiseringen bli forhøyet til en " variant av bekymring ". Hvis det er klare bevis på at effektiviteten av forebyggings- eller intervensjonstiltak for en bestemt variant er vesentlig redusert, betegnes den varianten som en "variant av høy konsekvens".

Varianter av bekymring (WHO)

Nedenfor er oppført varianter av bekymring (VOC) som for tiden er anerkjent av Verdens helseorganisasjon . Andre organisasjoner som CDC i USA har til tider brukt en litt annen liste, men fra juli 2021 samsvarer listen deres med WHO.

Falske farger transmisjonselektron-mikrobilde av en variant B.1.1.7 coronavirus. Variantens økte overførbarhet antas å skyldes endringer i strukturen til piggproteinene, vist her i grønt.

Alpha (avstamning B.1.1.7)

Først oppdaget i oktober 2020 under COVID-19-pandemien i Storbritannia fra en prøve tatt forrige måned i Kent, avstamning B.1.1.7, merket Alpha-variant av WHO, var tidligere kjent som den første varianten under etterforskning i desember 2020 (VUI-202012/01) og senere notert som VOC-202012/01. Det er også kjent som 20I (V1), 20I/501Y.V1 (tidligere 20B/501Y.V1) eller 501Y.V1. Siden den gang har utbredelsesoddsene doblet seg hver 6,5 dag, det antatte generasjonsintervallet. Det er korrelert med en betydelig økning i frekvensen av COVID-19-infeksjon i Storbritannia , delvis assosiert med N501Y- mutasjonen. Det hadde vært noen bevis på at denne varianten hadde 40–80% økt overførbarhet (med de fleste estimatene som lå rundt midten til høyere ende av dette området), og tidlige analyser antydet en økning i dødelighet, selv om nyere arbeid ikke har funnet tegn til økt virulens. I mai 2021 har Alpha -varianten blitt oppdaget i rundt 120 land.

B.1.1.7 med E484K

Variant of Concern 21FEB -02 (tidligere skrevet som VOC -202102/02), beskrevet av Public Health England (PHE) som "B.1.1.7 med E484K" er av samme slekt i Pango -nomenklatursystemet, men har en ekstra E484K mutasjon. 17. mars 2021 er det 39 bekreftede tilfeller av VOC -21FEB -02 i Storbritannia. Mars 2021 rapporterte forskere B.1.1.7 med E484K -mutasjoner i delstaten Oregon . I 13 testprøver analysert hadde man denne kombinasjonen, som syntes å ha oppstått spontant og lokalt, i stedet for å bli importert. Andre navn på denne varianten inkluderer B.1.1.7+E484K og B.1.1.7 Lineage med S: E484K.

Beta (avstamning B.1.351)

18. desember 2020 og den 501.V2 variant , også kjent som 501.V2, 20 H (V2), 20 H / 501Y.V2 (tidligere 20C / 501Y.V2), 501Y.V2, VOC-20DEC-02 (tidligere VOC - 202012/02), eller avstamning B.1.351, ble først oppdaget i Sør -Afrika og rapportert av landets helseavdeling . Det har blitt merket som Beta -variant av WHO. Forskere og tjenestemenn rapporterte at prevalensen av varianten var høyere blant unge mennesker uten underliggende helsemessige forhold, og sammenlignet med andre varianter resulterer den oftere i alvorlig sykdom i disse tilfellene. Den sørafrikanske helseavdelingen indikerte også at varianten kan kjøre den andre bølgen av COVID-19-epidemien i landet på grunn av at varianten spredte seg i et raskere tempo enn andre tidligere varianter av viruset.

Forskere bemerkes at varianten inneholder flere mutasjoner som gjør at det fester seg lettere til humane celler på grunn av de følgende tre mutasjoner i reseptor-bindingsdomenet (RBD) i pigg glykoprotein av viruset: N501Y , K417N, og E484K . N501Y -mutasjonen er også påvist i Storbritannia.

Gamma (avstamning s.1)

Gamma-varianten eller avstamningen P.1, betegnet Variant of Concern 21JAN-02 (tidligere VOC-202101/02) av Public Health England, 20J (V3) eller 20J/501Y.V3 av Nextstrain , eller bare 501Y.V3, ble oppdaget i Tokyo 6. januar 2021 av National Institute of Infectious Diseases (NIID). Det har blitt merket som gamma -variant av WHO. Den nye varianten ble først identifisert hos fire personer som ankom Tokyo etter å ha reist fra den brasilianske Amazonas-staten 2. januar 2021. 12. januar 2021 bekreftet CADDE-senteret Brasil-Storbritannia 13 lokale tilfeller av den nye Gamma-varianten i Amazonas regnskog. Denne varianten av SARS-CoV-2 har fått navnet avstamning P.1 (selv om det er en etterkommer av B.1.1.28, er navnet B.1.1.28.1 ikke tillatt, og det resulterende navnet er P.1), og har 17 unike aminosyreendringer, hvorav 10 i piggproteinet , inkludert de tre om mutasjoner: N501Y , E484K og K417T.

N501Y- og E484K-mutasjonene favoriserer dannelsen av et stabilt RBD-hACE2-kompleks, og øker dermed bindingsaffiniteten til RBD til hACE2. Imidlertid misliker K417T -mutasjonen kompleks formasjon mellom RBD og hACE2, som har vist seg å redusere bindingsaffiniteten.

Den nye varianten var fraværende i prøver som ble samlet inn fra mars til november 2020 i Manaus, delstaten Amazonas , men den ble oppdaget for samme by i 42% av prøvene fra 15. – 23. Desember 2020, etterfulgt av 52,2% i løpet av 15. – 31. Desember og 85,4% i løpet av 1–9 januar 2021. En studie fant at infeksjoner med Gamma kan gi nesten ti ganger mer virusbelastning sammenlignet med personer som er smittet av en av de andre linjene identifisert i Brasil (B.1.1.28 eller B.1.195). Gamma viste også 2,2 ganger høyere smittbarhet med samme evne til å infisere både voksne og eldre personer, noe som tyder på at P.1 og P.1-lignende linjer er mer vellykkede til å smitte yngre mennesker uavhengig av kjønn.

En studie av prøver som ble samlet i Manaus mellom november 2020 og januar 2021, indikerte at Gamma -varianten er 1,4–2,2 ganger mer overførbar og har vist seg å kunne unngå 25–61% av arvet immunitet fra tidligere koronavirussykdommer, noe som fører til muligheten av reinfeksjon etter gjenoppretting etter en tidligere COVID-19 infeksjon. Når det gjelder dødelighetsforholdet, ble infeksjoner av Gamma også funnet å være 10–80% mer dødelige.

En studie fant at personer som er fullstendig vaksinert med Pfizer eller Moderna, har betydelig redusert nøytraliseringseffekt mot Gamma, selv om den faktiske virkningen på sykdomsforløpet er usikker. En pre-print studie av Oswaldo Cruz Foundation publisert i begynnelsen av april fant at reell ytelse av mennesker med den første dosen av Sinovac 's Coronavac Vaksine hadde omtrent 50% effektiv rente. De forventet at effekten skulle være høyere etter den andre dosen. Fra juli 2021 pågår studien.

Foreløpige data fra to studier indikerer at Oxford - AstraZeneca -vaksinen er effektiv mot Gamma -varianten, selv om det eksakte effektnivået ennå ikke er offentliggjort. Foreløpige data fra en studie utført av Instituto Butantan tyder på at CoronaVac også er effektiv mot Gamma -varianten, og fra juli 2021 har det ennå ikke blitt utvidet for å få endelige data.

Delta (avstamning B.1.617.2)

Delta -varianten, også kjent som B.1.617.2, G/452R.V3, 21A eller 21A/S: 478K, er en globalt dominerende variant som spredte seg til minst 185 land. Det ble først oppdaget i India . Etterkommer av avstamning B.1.617, som også inkluderer Kappa -varianten som blir undersøkt, den ble først oppdaget i oktober 2020 og har siden spredt seg internasjonalt. Mai 2021 erklærte britiske forskere B.1.617.2 (som spesielt mangler mutasjon ved E484Q) som en "variant av bekymring", og merket den VOC-21APR-02, etter at de flagget bevis på at den sprer seg raskere enn den opprinnelige versjonen av viruset og kan spre seg raskere eller like raskt som Alpha. Den bærer L452R- og P681R -mutasjoner i Spike; i motsetning til Kappa bærer den T478K, men ikke E484Q.

Juni 2021 rapporterte Public Health England at tolv av de 42 dødsfallene fra Delta -varianten i England var blant de fullstendig vaksinerte, og at den spredte seg nesten dobbelt så raskt som Alpha -varianten. 11. juni rapporterte Foothills Medical Center i Calgary, Canada at halvparten av deres 22 tilfeller av Delta -varianten skjedde blant de fullstendig vaksinerte.

I juni 2021 begynte det å dukke opp rapporter om en variant av Delta med K417N -mutasjonen. Mutasjonen, som også er tilstede i beta- og gamma -variantene, vekket bekymring for muligheten for redusert effektivitet av vaksiner og antistoffbehandlinger og økt risiko for reinfeksjon. Varianten, kalt "Delta with K417N" av Public Health England, inkluderer to klader som tilsvarer Pango -linjene AY.1 og AY.2. Det har fått kallenavnet "Delta plus" fra "Delta plus K417N". Mutasjonens navn, K417N, refererer til en utveksling der lysin (K) erstattes av asparagin (N) i posisjon 417. 22. juni erklærte Indias helse- og familieverndepartement "Delta plus" -varianten av COVID-19 en variant av bekymring etter at 22 tilfeller av varianten ble rapportert i India. Etter kunngjøringen sa ledende virologer at det ikke var tilstrekkelige data for å støtte merking av varianten som en distinkt bekymringsvariant, og pekte på det lille antallet pasienter som ble undersøkt.

Varianter av interesse (WHO)

Nedenfor er oppført variantene av interesse (VOI) som fra august 2021 ble anerkjent av Verdens helseorganisasjon . Andre organisasjoner som CDC i USA kan til tider bruke en litt annen liste.

Lambda (avstamning C.37)

Lambda -varianten, også kjent som avstamning C.37, ble først oppdaget i Peru i august 2020 og ble utpekt av WHO som en variant av interesse 14. juni 2021. Den spredte seg til minst 30 land rundt om i verden og, pr. Juli 2021 er det ukjent om det er mer smittsomt og motstandsdyktig mot vaksiner enn andre stammer.

Mu (avstamning B.1.621)

Mu -varianten, også kjent som avstamning B.1.621, ble først oppdaget i Colombia i januar 2021 og ble utpekt av WHO som en variant av interesse 30. august 2021. Det har vært utbrudd i Sør -Amerika og Europa.

Tidligere varianter av interesse

Epsilon (avstamninger B.1.429, B.1.427, CAL.20C)

Epsilon-varianten eller avstamningen B.1.429, også kjent som CAL.20C eller CA  VUI1, 21C eller 20C/S: 452R, er definert av fem forskjellige mutasjoner (I4205V og D1183Y i ORF1ab-genet, og S13I, W152C, L452R i piggproteinets S-gen), hvorav L452R (tidligere også påvist i andre ikke-relaterte avstamninger) var særlig bekymringsfull. Fra 17. mars til 29. juni 2021 oppførte CDC B.1.429 og tilhørende B.1.427 som "bekymringsvarianter". Fra juli 2021 blir Epsilon ikke lenger ansett som en variant av interesse av WHO, ettersom den ble overhalet av Alpha.

Fra september 2020 til januar 2021 var det 19% til 24% mer overførbart enn tidligere varianter i California. Nøytralisering mot det av antistoffer fra naturlige infeksjoner og vaksinasjoner ble moderat redusert, men det forble påviselig i de fleste diagnostiske tester.

Epsilon (CAL.20C) ble først observert i juli 2020 av forskere ved Cedars-Sinai Medical Center , California , i en av 1230 virusprøver samlet i Los Angeles County siden starten av COVID-19-epidemien . Det ble ikke oppdaget igjen før i september da det dukket opp igjen blant prøver i California, men antallet forble veldig lavt til november. I november 2020 utgjorde Epsilon-varianten 36 prosent av prøvene som ble samlet inn på Cedars-Sinai Medical Center, og innen januar 2021 utgjorde Epsilon-varianten 50 prosent av prøvene. I en felles pressemelding fra University of California, San Francisco , California Department of Public Health og Santa Clara County Public Health Department , ble varianten også oppdaget i flere fylker i Nord -California. Fra november til desember 2020 økte frekvensen av varianten i sekvenserte saker fra Nord -California fra 3% til 25%. I et fortrykk beskrives CAL.20C som tilhørende klade 20C og bidrar med omtrent 36% av prøvene, mens en voksende variant fra 20G -kladen står for rundt 24% av prøvene i en studie fokusert på Sør -California. Vær imidlertid oppmerksom på at i USA som helhet dominerer 20G -kladen fra januar 2021. Etter det økende antallet Epsilon i California har varianten blitt oppdaget med varierende frekvenser i de fleste amerikanske stater. Små tall er oppdaget i andre land i Nord -Amerika, og i Europa, Asia og Australia. Etter en første økning falt frekvensen raskt fra februar 2021 da den ble utkonkurrert av den mer overførbare Alpha . I april forble Epsilon relativt hyppig i deler av Nord -California, men det hadde praktisk talt forsvunnet fra den sørlige delen av staten og hadde aldri klart å etablere fotfeste andre steder; bare 3,2% av alle tilfeller i USA var Epsilon, mens mer enn to tredjedeler var Alpha.

Zeta (avstamning s.2)

Zeta-variant eller avstamning P.2, en underlinje av B.1.1.28 som Gamma (P.1), ble først oppdaget i omløp i delstaten Rio de Janeiro ; den har E484K -mutasjonen, men ikke N501Y- og K417T -mutasjonene. Det utviklet seg uavhengig i Rio de Janeiro uten å være direkte relatert til Gamma -varianten fra Manaus. Selv om Zeta tidligere ble merket som en variant av interesse, fra juli 2021, blir det ikke lenger ansett som sådan av WHO.

Theta (avstamning s.3)

Februar 2021 bekreftet Department of Health of the Philippines at det ble påvist to mutasjoner av COVID-19 i Central Visayas etter at prøver fra pasienter ble sendt for å gjennomgå genom-sekvensering. Mutasjonene ble senere navngitt som E484K og N501Y, som ble påvist i 37 av 50 prøver, med begge mutasjonene forekommende i 29 av disse.

13. mars bekreftet Helsedepartementet at mutasjonene utgjør en variant som ble betegnet som avstamning P.3. Samme dag bekreftet den også den første COVID-19-saken forårsaket av Gamma-varianten i landet. Filippinene hadde 98 tilfeller av Theta -varianten 13. mars. 12. mars ble det kunngjort at Theta også var påvist i Japan. 17. mars bekreftet Storbritannia sine to første tilfeller, der PHE kalte det VUI-21MAR-02. April 2021 oppdaget Malaysia åtte tilfeller av Theta -varianten i Sarawak.

Fra juli 2021 blir Theta ikke lenger ansett som en variant av interesse av WHO.

Eta (avstamning B.1.525)

Eta-varianten eller avstamningen B.1.525, også kalt VUI -21FEB-03 (tidligere VUI-202102/03) av Public Health England (PHE) og tidligere kjent som UK1188, 21D eller 20A/S: 484K, bærer ikke det samme N501Y-mutasjon funnet i Alpha , Beta og Gamma , men bærer den samme E484K-mutasjonen som finnes i Gamma-, Zeta- og Beta-variantene, og bærer også den samme ΔH69/ΔV70-sletting (en sletting av aminosyrene histidin og valin i posisjoner 69 og 70) som funnet i Alpha, N439K -variant (B.1.141 og B.1.258) og Y453F -variant ( Cluster 5 ). Eta skiller seg fra alle andre varianter ved å ha både E484K-mutasjonen og en ny F888L-mutasjon (en substitusjon av fenylalanin (F) med leucin (L) i S2-domenet til piggproteinet). 5. mars 2021 hadde den blitt oppdaget i 23 land. Det har også blitt rapportert i Mayotte , den utenlandske avdelingen/regionen i Frankrike. De første tilfellene ble oppdaget i desember 2020 i Storbritannia og Nigeria, og fra 15. februar 2021 hadde det skjedd med den høyeste frekvensen blant prøver i sistnevnte land. 24. februar ble det funnet 56 tilfeller i Storbritannia. Danmark, som sekvenserer alle sine COVID-19-saker, fant 113 tilfeller av denne varianten fra 14. januar til 21. februar 2021, hvorav syv var direkte knyttet til utenlandsreiser til Nigeria.

Fra juli 2021 studerer britiske eksperter det for å finne ut hvor stor en risiko det kan være. Det blir for øyeblikket sett på som en "variant under etterforskning", men i påvente av ytterligere studier kan det bli en " variant av bekymring ". Ravi Gupta , fra University of Cambridge sa i et BBC -intervju at avstamning B.1.525 så ut til å ha "betydelige mutasjoner" som allerede er sett i noen av de andre nyere variantene, noe som betyr at deres sannsynlige effekt til en viss grad er mer forutsigbar.

Iota (avstamning B.1.526)

I november 2020 ble en mutant variant oppdaget i New York City, som fikk navnet B.1.526. 11. april 2021 har varianten blitt oppdaget i minst 48 amerikanske stater og 18 land. I et mønster som speiler Epsilon, var Iota i utgangspunktet i stand til å nå relativt høye nivåer i noen stater, men i mai 2021 ble den utkonkurrert av det mer overførbare Delta og Alpha.

Kappa (avstamning B.1.617.1)

Kappa -varianten er en av de tre underavdelingene til avstamning B.1.617 . Det er også kjent som avstamning B.1.617.1, 21B eller 21A/S: 154K, og ble først oppdaget i India i desember 2020. I slutten av mars 2021 sto Kappa for mer enn halvparten av sekvensene som ble sendt fra India . April 2021 ble den utpekt som en variant under etterforskning (VUI-21APR-01) av Public Health England. Den har de bemerkelsesverdige mutasjonene L452R, E484Q, P681R.

Varsler for videre overvåking (WHO)

Definert som varianter med genetiske endringer som mistenkes å påvirke virusegenskaper og noen indikasjoner på å utgjøre en fremtidig risiko, men med uklare bevis på fenotypisk eller epidemiologisk påvirkning, som krever forbedret overvåking og gjentatt vurdering etter nye bevis.

16. september 2021
Pango slekt GISAID -klade Nextstrain clade Tidligste prøver Dato for betegnelse Merknader
R.1 GR 2021-01 2021-04-07 National Institute of Infectious Diseases i Japan variant av interesse. Den har E484K -mutasjonen på reseptorbindingsdomenet og W152L -mutasjonen på N Terminal Domain, som begge kan ha implikasjoner for immunutslipp. Det har blitt funnet i 30 land med 7057 tilfeller i Japan og 1249 tilfeller i USA. En liten studie i USA fant at Pfizer-Biontech-vaksinen var 94% effektiv mot sykehusinnleggelse og død fra R.1 under et utbrudd. I Japan fortsetter tilfeller av R.1 å vises.
B.1.466.2 GH 2020-11 2021-04-28 Første prøve i Indonesia .
B.1.1.318 GR 2021-01 2021-06-02 Public Health England VUI (VUI-21FEB-04, tidligere VUI-202102/04) 24. februar 2021. 16 tilfeller av det ble oppdaget i Storbritannia. 155 tilfeller ble oppdaget i provinsen Ontario, Canada mellom 30. mai og 26. juni 2021. Den fikk navnet Fin-796H da den ble oppdaget i Finland , noe som indikerer mutasjonen av D796H, og er fast bestemt på å stamme fra Nigeria . Varianten har også E484K -mutasjon.
B.1.1.519 GR 20B/S.732A 2020-11 2021-06-02
C.36.3 GR 2021-01 2021-06-16
B.1.214.2 G 2020-11 2021-06-30
B.1.427
B.1.429
GH/452R.V1 21C 2020-03 2021-07-06 Epsilon , første prøve i USA .
B.1.1.523 GR 2020-05 2021-07-14
B.1.619 G 2020-05 2021-07-14
B.1.620 G 20A/S.126A 2020-11 2021-07-14 Oppdaget i Litauen i mars 2021 også kjent som den 'litauiske stammen'. Den ble funnet i Sentral -Afrika så vel som i Nord -Amerika. Bortsett fra Litauen har også andre europeiske land, inkludert Frankrike og Belgia , funnet tilstedeværelse av denne varianten. Denne slekten har 23 mutasjoner og slettinger sammenlignet med referansestammen, hvorav noen er unike mutasjoner. Slekten inneholder en E484K -mutasjon. D614G, en mutasjon som finnes i de fleste sirkulerende stammer, finnes også i denne varianten. Andre bemerkelsesverdige mutasjoner inkluderer P681H og S477N.
C.1.2 GR 2021-05 2021-09-01 Identifisert i mai 2021 da den utgjorde 0,2% (2/1054) av genomene sekvensert i Sør -Afrika, og steg i juni til 1,6% (25/2177), og i juli til 2,0% (26/1326), tilsvarende økningen av tidlig påvisning av beta- og delta -variantene. I juni 2021 ble den oppdaget i England og Kina , og fra 13. august 2021 hadde den også blitt oppdaget i Portugal , Sveits , Den demokratiske republikken Kongo (DRC), Mauritius og New Zealand . C.1.2 inneholder flere substitusjoner (C136F, R190S, D215G, Y449H, N484K, N501Y , H655Y, N679K og T859N) og slettinger (Y144del, L242-A243del) i piggproteinet. Varianten muteres angivelig med høyere hastighet enn andre VOC.

Andre bemerkelsesverdige varianter

Lineage B.1.1.207 ble først sekvensert i august 2020 i Nigeria; implikasjonene for overføring og virulens er uklare, men den har blitt oppført som en voksende variant av de amerikanske sentrene for sykdomskontroll . Denne varianten er sekvensert av African Center of Excellence for Genomics of Infectious Diseases i Nigeria, og har en P681H -mutasjon, felles med Alpha -varianten . Den deler ingen andre mutasjoner med Alpha -varianten, og fra slutten av desember 2020 står denne varianten for rundt 1% av virale genomer som er sekvensert i Nigeria, selv om dette kan stige. Fra mai 2021 har avstamning B.1.1.207 blitt oppdaget i 10 land.

Linje B.1.1.317, selv om den ikke regnes som en variant av bekymring , er bemerkelsesverdig ved at Queensland Health tvang 2 personer som foretok hotellkarantene i Brisbane , Australia til å gjennomgå ytterligere 5 dagers karantene på toppen av de obligatoriske 14 dagene etter at det ble bekreftet de var infisert med denne varianten.

Linje B.1.616, som ble identifisert i Vest -Frankrike i begynnelsen av januar 2021 og utpekt av WHO som "variant under etterforskning" i mars 2021, ble rapportert å være vanskelig å oppdage fra nasofaryngeal vattpinneprøvetakingsmetode for påvisning av koronavirus og påvisning av virusbehovet å stole på prøver fra nedre luftveier.

Lineage B.1.618 ble først isolert i oktober 2020. Den har E484K -mutasjonen til felles med flere andre varianter, og viste betydelig spredning i april 2021 i Vest -Bengal , India. 23. april 2021 viste PANGOLIN-databasen 135 sekvenser oppdaget i India, med tall på ett tall i hvert av åtte andre land over hele verden.

Bemerkelsesverdige missense -mutasjoner

Det har vært observert en rekke missense-mutasjoner av SARS-CoV-2.

del 69-70

Navnet på mutasjonen, del 69-70 eller 69-70 del, eller andre lignende notasjoner, refererer til sletting av aminosyre i posisjon 69 til 70. Mutasjonen finnes i Alpha-varianten, og kan føre til "pigg" genmålssvikt "og resultere i falskt negativt resultat i PCR -virustest.

RSYLTPGD246-253N

Ellers referert til som del 246-252, eller andre forskjellige lignende uttrykk, refererer til sletting av aminosyre fra posisjonen 246 til 252, i det N-terminale domenet til piggprotein, ledsaget av en erstatning av asparaginsyren (D ) i posisjon 253 for asparagin (N).

Den 7 aminosyresletningsmutasjonen er for tiden beskrevet som unik i Lambda -varianten, og har blitt tilskrevet som en av årsakene til stammeens økte evne til å rømme fra nøytraliserende antistoffer i henhold til fortrykkpapir.

N440K

Navnet på mutasjonen, N440K, refererer til en utveksling der asparaginen (N) erstattes av lysin (K) i posisjon 440.

Denne mutasjonen har blitt observert i cellekulturer for å være 10 ganger mer smittsom sammenlignet med den tidligere utbredte A2a -stammen (A97V -substitusjon i RdRP -sekvens) og 1000 ganger mer i den mindre utbredte A3i -stammen (D614G -substitusjon i Spike og en og P323L -substitusjon i RdRP ). Det var involvert i raske stigninger i Covid -tilfeller i India i mai 2021. India har den største andelen N440K -muterte varianter etterfulgt av USA og Tyskland.

G446V

Navnet på mutasjonen, G446V, refererer til en utveksling der glycin (G) erstattes av valin (V) i posisjon 446.

Mutasjonen, identifisert i Japan blant inngående reisende med start fra mai, og blant 33 prøver fra personer knyttet til 2020 Tokyo OL og 2020 Tokyo paralympiske leker , er sagt å være mulig å virkningen affinitet av flere monoklonalt antistoff , selv om klinisk effekt mot bruk av antistoffmedisin er fremdeles ukjent.

L452R

Navnet på mutasjonen, L452R, refererer til en utveksling der leucin (L) erstattes av arginin (R) i posisjon 452.

L452R finnes i både Delta- og Kappa -variantene som først sirkulerte i India, men siden har spredt seg rundt om i verden. L452R er en relevant mutasjon i denne stammen som forbedrer ACE2-reseptorbindingsevnen og kan redusere vaksinestimulerte antistoffer fra å feste seg til dette endrede piggproteinet.

Noen studier viser at L452R til og med kan gjøre koronaviruset motstandsdyktig mot T-celler, som er en klasse celler som er nødvendige for å målrette og ødelegge virusinfiserte celler. De er forskjellige fra antistoffer som er nyttige for å blokkere koronaviruspartikler og forhindre at de sprer seg.

Y453F

Navnet på mutasjonen, Y453F, refererer til en utveksling der tyrosin (Y) erstattes av fenylalanin (F) i posisjon 453. Mutasjonen er funnet potensielt knyttet til spredningen av SARS-CoV-2 blant minker i Nederland i 2020.

S477G/N

En svært fleksibel region i reseptorbindingsdomenet (RBD) av SARS-CoV-2, som starter fra rest 475 og fortsetter til rest 485, ble identifisert ved bruk av bioinformatikk og statistiske metoder i flere studier. University of Graz og Biotech Company Innophore har i en fersk publikasjon vist at strukturelt viser posisjonen S477 størst fleksibilitet blant dem.

Samtidig er S477 hittil den hyppigst utvekslede aminosyreresten i RBD-ene til SARS-CoV-2-mutanter. Ved å bruke molekylær dynamikk simuleringer av RBD under bindingsprosessen til hACE2, har det blitt vist at både S477G og S477N styrker bindingen av SARS-COV-2 piggen med hACE2 reseptoren. Vaksineutvikleren BioNTech omtalte denne aminosyreutvekslingen som relevant med tanke på fremtidig vaksinedesign i et fortrykk publisert i februar 2021.

E484Q

Navnet på mutasjonen, E484Q, refererer til en utveksling der glutaminsyren (E) erstattes av glutamin (Q) i posisjon 484.

Den Kappa -varianten som sirkulerer i India har E484Q. Disse variantene ble opprinnelig (men misvisende) referert til som en "dobbeltmutant". E484Q kan forbedre ACE2-reseptorbindingsevnen, og kan redusere vaksinestimulerte antistoffers evne til å feste seg til dette endrede piggproteinet.

E484K

Navnet på mutasjonen, E484K, refererer til en utveksling der glutaminsyren (E) erstattes av lysin (K) i posisjon 484. Den har tilnavnet "Eeek".

E484K har blitt rapportert å være en flukt mutasjon (dvs. en mutasjon som forbedrer en virusets evne til å unngå vertens immunsystem ) fra minst én form av monoklonalt antistoff mot SARS-CoV-2, indikerer at det kan være et "mulig endring i antigenisitet ". Gamma -varianten (avstamning P.1), Zeta -varianten (avstamning P.2, også kjent som avstamning B.1.1.28.2) og Beta -varianten (501.V2) viser denne mutasjonen. Et begrenset antall avstamning B.1.1.7 genomer med E484K -mutasjon er også påvist. Det er rapportert at monoklonale og serumavledede antistoffer er fra 10 til 60 ganger mindre effektive i å nøytralisere virus som bærer E484K-mutasjonen. Februar 2021 rapporterte medisinske forskere i Storbritannia påvisning av E484K i 11 prøver (av 214 000 prøver), en mutasjon som kan svekke dagens vaksineeffektivitet.

F490S

F490S betegner en endring fra fenylalanin (F) til serin (S) i aminosyrestilling 490.

Det er en av mutasjonene som finnes i Lambda, og har vært assosiert med redusert mottakelighet for antistoff generert av de som var infisert med andre stammer, noe som betyr at antistoffbehandling mot personer smittet med stammer som bærer slik mutasjon ville være mindre effektiv.

N501Y

N501Y betegner en endring fra asparagin (N) til tyrosin (Y) i aminosyrestilling 501. N501Y har fått tilnavnet "Nelly".

Denne endringen er antatt ved PHE for å øke bindingsaffiniteten på grunn av sin posisjon inne i piggen glykoprotein 's reseptor-bindende domene som binder ACE2 i humane celler; data støtter også hypotesen om økt bindingsaffinitet fra denne endringen. Molekylær interaksjonsmodellering og den frie energien til bindingsberegninger har vist at mutasjonen N501Y har den høyeste bindingsaffiniteten i varianter som angår RBD til hACE2. Varianter med N501Y inkluderer Gamma, Alpha (VOC 20DEC-01), Beta og COH.20G/501Y (identifisert i Columbus, Ohio ). Dette ble sist den dominerende formen for viruset i Columbus i slutten av desember 2020 og januar og ser ut til å ha utviklet seg uavhengig av andre varianter.

N501S

N501S betegner en endring fra asparagin (N) til serin (S) i aminosyrestilling 501.

Fra september 2021 er det 8 tilfeller av pasienter rundt om i verden som er infisert med Delta -variant som har denne N501S -mutasjonen. Siden det regnes som en mutasjon som ligner på N501Y, mistenkes det å ha lignende egenskaper som N501Y -mutasjon, som antas å øke smittsomheten til viruset, men den eksakte effekten er ukjent ennå.

D614G

Utbredelse av mutasjon D614G på tvers av alle rapporterte GISAID -stammer i løpet av 2020. Konvergens med enhet samsvarer tett med øvre lem på logistikkurven .

D614G er en missense-mutasjon som påvirker piggproteinet til SARS-CoV-2. Fra tidlig opptreden i Øst -Kina tidlig i 2020 har hyppigheten av denne mutasjonen i den globale viruspopulasjonen økt under pandemien. G ( glycin ) har erstattet D ( asparaginsyre ) i posisjon 614 i mange land, spesielt i Europa, men saktere i Kina og resten av Øst -Asia, noe som støtter hypotesen om at G øker overføringshastigheten, noe som er i samsvar med høyere viraltitre og smittsomhet in vitro. Forskere med PANGOLIN -verktøyet kalte denne mutasjonen "Doug".

I juli 2020 ble det rapportert at den mer smittsomme D614G SARS-CoV-2-varianten hadde blitt den dominerende formen i pandemien. PHE bekreftet at D614G -mutasjonen hadde en "moderat effekt på overførbarhet" og ble sporet internasjonalt.

Den globale forekomsten av D614G korrelerer med forekomsten av tap av lukt ( anosmi ) som et symptom på COVID-19, muligens formidlet av høyere binding av RBD til ACE2-reseptoren eller høyere proteinstabilitet og dermed høyere smittsomhet i olfaktorisk epitel .

Varianter som inneholder D614G -mutasjonen finnes i G -kladen av GISAID og B.1 -kladen av PANGOLIN -verktøyet.

Q677P/H

Navnet på mutasjonen, Q677P/H, refererer til en utveksling der glutamin (Q) erstattes av prolin (P) eller histidin (H) i posisjon 677.

Mutasjonen har blitt rapportert i flere avstamninger som sirkulerte inne i USA i slutten av 2020, og også noen avstamninger utenfor landet. Frekvensen for slik mutasjon som blir registrert har økt fra slutten av 2020 til begynnelsen av 2021.

P681H

Logaritmisk prevalens av P681H i 2020 i henhold til sekvenser i GISAID -databasen

Navnet på mutasjon, P681H, refererer til en utveksling hvorved prolin (P) er erstattet med histidin (H) ved posisjon 681.

I januar 2021 rapporterte forskere i et fortrykk at mutasjonen P681H, et karakteristisk trekk ved Alpha -varianten og avstamning B.1.1.207 (identifisert i Nigeria), viser en betydelig eksponentiell økning i verdensomspennende frekvens, og følger dermed en trend som skal være forventet i nedre lem på logistikkurven. Dette kan sammenlignes med trenden med den nå globalt utbredte D614G.

P681R

Navnet på mutasjon, P681R, refererer til en utveksling hvorved prolin (P) er erstattet med arginin (R) ved posisjon 681.

Indian SARS-CoV-2 Genomics Consortium ( INSACOG ) fant at bortsett fra de to mutasjonene E484Q og L452R, er det også en tredje signifikant mutasjon, P681R i avstamning B.1.617. Alle tre om mutasjoner er på piggproteinet, den operative delen av koronaviruset som binder seg til reseptorceller i kroppen.

A701V

I følge første medieoppslag kunngjorde det malaysiske helsedepartementet 23. desember 2020 at det hadde oppdaget en mutasjon i SARS-CoV-2-genomet som de utpekte som A701B (sic), blant 60 prøver samlet inn fra Benteng Lahad Datu-klyngen i Sabah . Mutasjonen ble karakterisert som lik den som ble funnet nylig på den tiden i Sør -Afrika, Australia og Nederland, selv om det var usikkert om denne mutasjonen var mer smittsom eller aggressiv enn før. Provinsregjeringen i Sulu i nabolandet Filippinene suspenderte midlertidig reiser til Sabah som svar på oppdagelsen av 'A701B' på grunn av usikkerhet om mutasjonens art.

25. desember 2020 beskrev det malaysiske helsedepartementet en mutasjon A701V som sirkulert og tilstede i 85% av tilfellene (D614G var til stede i 100% av tilfellene) i Malaysia. Disse rapportene refererte også til prøver samlet fra Benteng Lahad Datu -klyngen. Teksten til kunngjøringen ble speilet ordrett på Facebook-siden til Noor Hisham Abdullah , malaysisk generaldirektør, som ble sitert i noen av nyhetsartiklene.

A701V -mutasjonen har aminosyren alanin (A) substituert med valin (V) i posisjon 701 i piggproteinet. Globalt rapporterte Sør -Afrika, Australia, Nederland og England også A701V omtrent på samme tid som Malaysia. I GISAID er prevalensen av denne mutasjonen funnet å være omtrent 0,18%. av saker.

April 2021 rapporterte det malaysiske helsedepartementet at den tredje bølgen, som hadde startet i Sabah, har involvert introduksjon av varianter med D614G- og A701V -mutasjoner.

Differensiell vaksineeffektivitet

Se også klinisk forskning av COVID-19-vaksine (effektivitet)

Data og metoder

Moderne DNA-sekvensering , hvis tilgjengelig, kan tillate rask deteksjon (noen ganger kjent som ' sanntidsdeteksjon ') av genetiske varianter som forekommer i patogener under sykdomsutbrudd. Gjennom bruk av fylogenetisk trevisualiseringsprogramvare kan registreringer av genom -sekvenser grupperes i grupper av identiske genomer som alle inneholder det samme settet med mutasjoner. Hver gruppe representerer en 'variant', 'clade' eller 'avstamning', og sammenligning av sekvensene gjør at den evolusjonære banen til et virus kan utledes. For SARS-CoV-2 har over 330 000 virale genomiske sekvenser blitt generert av molekylære epidemiologiske studier over hele verden.

Ny variant deteksjon og vurdering

Januar 2021 sa den britiske regjeringen at den ville dele sine genomiske sekvenseringskapasiteter med andre land for å øke genomisk sekvensering og spore nye varianter, og kunngjorde en "New Variant Assessment Platform". Fra januar 2021 ble mer enn halvparten av all genomisk sekvensering av COVID-19 utført i Storbritannia.

Testing

Juni 2021 introduserte Public Health England en regelbasert beslutningsalgoritme for å skille mellom varianter i RT-PCR-resultater. Systemet gjennomgås ukentlig. Spesielt krever reglene at spesifikke mutasjoner i S -genet er tilstede for hver variant (P681R for Delta, K417N for Beta og K417T for Gamma); bekreftelsesstatusen for testen er også avhengig av andre krav for påvisning eller ikke-påvisning av tilstedeværelse eller fravær av disse mutasjonene og mutasjonene N501Y og E484K. Der resultatet er 'ubestemt', er to kategorier mulige: med eller uten E484K. .

Inkubasjonsteori for flere muterte varianter

Forskere har antydet at flere mutasjoner kan oppstå i løpet av den vedvarende infeksjonen til en immunsupprimert pasient, spesielt når viruset utvikler fluktmutasjoner under utvalgstrykket av antistoff eller rekonvalescerende plasmabehandling , med de samme slettingene i overflateantigener som gjentatte ganger gjentar seg hos forskjellige pasienter .

Overføring på tvers av arter

Klynge 5

I begynnelsen av november 2020 ble Cluster 5 , også referert til som ΔFVI-pigg av danske State Serum Institute (SSI), oppdaget på Nordjylland , Danmark, og antas å ha blitt spredt fra mink til mennesker via minkfarmer . 4. november 2020 ble det kunngjort at minkbestanden i Danmark ville bli utslettet for å forhindre mulig spredning av denne mutasjonen og redusere risikoen for at nye mutasjoner skjer. En innestengning og reisebegrensninger ble innført i syv kommuner i Nord-Jylland for å forhindre mutasjonen i å spre seg, noe som kan kompromittere nasjonale eller internasjonale reaksjoner på COVID-19-pandemien . November 2020 var det oppdaget rundt 214 minkrelaterte tilfeller av mennesker.

WHO har uttalt at klynge 5 har en "moderat redusert følsomhet for nøytraliserende antistoffer". SSI advarte om at mutasjonen kan redusere effekten av COVID-19-vaksiner under utvikling, selv om det var usannsynlig å gjøre dem ubrukelige. Etter lockdown og massetesting kunngjorde SSI 19. november 2020 at klynge 5 etter all sannsynlighet var utryddet. Fra 1. februar 2021 vurderte forfattere til en fagfellevurdert artikkel, som alle var fra SSI, at klynge 5 ikke var i omløp i den menneskelige befolkningen.

Det er en risiko for at COVID-19 kan overføres fra mennesker til andre dyrepopulasjoner og kan kombineres med andre dyrevirus for å skape enda flere varianter som er farlige for mennesker.

Se også

Merknader

Referanser

Videre lesning

Eksterne linker