Bakterielle isnukleeringsproteiner - Bacterial ice-nucleation proteins

Bakterielle isnukleeringsproteiner oktamer gjentas
Identifikatorer
Symbol Ice_nucleatn
Pfam PF00818
InterPro IPR000258
PROSITE PDOC00283

Bakterielle isnukleeringsproteiner er en familie av proteiner som gjør det mulig for Gram-negative bakterier å fremme isdannelse ved relativt høye temperaturer (over -5C). Disse proteinene er lokalisert på den ytre membranoverflaten og kan forårsake frostskader på mange planter. Den primære strukturen til proteinene inneholder et svært repeterende domene som dominerer sekvensen. Domenet består av et antall gjentakelser på 48 rester , som i seg selv inneholder 3 blokker med 16 rester, hvorav de første 8 er identiske. Det antas at det repeterende domenet kan være ansvarlig for å innrette vannmolekyler i frøkrystallen.

             [.........48.residues.repeated.domain..........]
            /              / |              | \              \
           AGYGSTxTagxxssli  AGYGSTxTagxxsxlt  AGYGSTxTaqxxsxlt
           [16.residues...]  [16.residues...]  [16.residues...]

Se også

Referanser

Denne artikkelen inneholder tekst fra det offentlige området Pfam og InterPro : IPR000258