Burkholderia -Burkholderia
Burkholderia | |
---|---|
B. pseudomallei -kolonier på en blodagarplate . | |
Vitenskapelig klassifisering | |
Kongedømme: | |
Filum: | |
Klasse: | |
Rekkefølge: | |
Familie: | |
Slekt: |
Burkholderia
Yabuuchi et al . 1993
|
Type art | |
Burkholderia cepacia (Palleroni og Holmes 1981) Yabuuchi et al . 1993
|
|
Arter | |
Se tekst. |
Burkholderia er en slekt av Proteobacteria hvis patogene medlemmer inkluderer Burkholderia cepacia -komplekset , som angriper mennesker og Burkholderia mallei , ansvarlig for kjertler , en sykdom som hovedsakelig forekommer hos hester og beslektede dyr; Burkholderia pseudomallei , forårsakende middel for melioidose ; og Burkholderia cepacia , et viktig patogen for lungeinfeksjoner hos personer med cystisk fibrose (CF). Burkholderia -arter finnes også i det marine miljøet. SI Paul et al. (2021) isolerte og karakteriserte Burkholderia cepacia fra marine svamper på Saint Martin's Island i Bay of Bengal , Bangladesh .
Den Burkholderia (tidligere del av Pseudomonas ) slekten navnet refererer til en gruppe av nesten allestedsnærværende Gram-negative , obligately aerobe , stavformede bakterier som er bevegelig ved hjelp av ett eller flere polare flageller , med unntak av Burkholderia mallei , som er motil . Medlemmer som tilhører slekten produserer ikke kapper eller protecer og kan bruke poly-beta-hydroksybutyrat (PHB) for vekst. Slekten inkluderer både dyre- og plantepatogener , samt noen miljøvennlige arter. Spesielt er B. xenovorans (tidligere kalt Pseudomonas cepacia deretter B. cepacia og B. fungorum ) kjent for å være katalasepositiv (påvirker pasienter med kronisk granulomatøs sykdom ) og dets evne til å bryte ned klororganiske plantevernmidler og polyklorerte bifenyler . Det bevarte RNA-strukturen anti-hemB RNA-motivet finnes i alle kjente bakterier i denne slekten.
På grunn av deres antibiotikaresistens og den høye dødeligheten fra de tilknyttede sykdommene, regnes B. mallei og B. pseudomallei for å være potensielle biologiske krigføringsmidler , rettet mot husdyr og mennesker.
Historie
Slekten ble oppkalt etter Walter H. Burkholder , plantepatolog ved Cornell University . De første artene som ble plassert i slekten var overføringer fra Pseudomonas , på grunnlag av forskjellige biokjemiske tester.
Inntil nylig var slekten Burkholderia inkluderende for alle Paraburkholderia -arter. Slekten Paraburkholderia er imidlertid fylogenetisk forskjellig, og kan skilles fra alle Burkholderia -arter på grunnlag av molekylære signaturer som er unikt funnet for hver slekt.
Taksonomi
Burkholderia -arter danner en monofyletisk gruppe innenfor Burkholderiales -rekkefølgen til Betaproteobacteria . For tiden kan de 48 gyldig navngitte artene skilles fra beslektede slekter (dvs. Paraburkholderia ) og alle andre bakterier ved bevarte signaturindeler i en rekke proteiner. Disse indlene representerer eksklusive felles aner som deles mellom alle Burkholderia -arter.
Slekten har tre forskjellige monofyletiske klynger. En gruppe består av alle arter som tilhører Burkholderia cepacia -komplekset, en annen klade består av B. pseudomallei og nært beslektede arter, og den siste kladen omfatter de fleste av de fytogene artene i slekten, inkludert B. glumae og B. gladioli . Bevarte signaturindeler er spesifikke for hver av disse undergruppene i slekten som hjelper til med å avgrense medlemmer av denne ekstremt store og mangfoldige slekten.
Forskning
Nylig har forskning på Burkholderia- arter undersøkt en rekke temaer og egenskaper, inkludert metabolomisk respons på antibiotika, kontaktavhengige interaksjoner mellom bakteriesamfunn og genomisk potensial for å gi fordelaktige produkter.
I Burkholderia -arter har visse antibiotika som trimethoprim vist seg å indusere og oppregulere en stor mengde metabolom , noe som induserer over 100 stille sekundære metabolittgenklynger i Burkholderia thailandensis . Disse globale aktivatorene kan brukes som en kilde til undersøkelse av hvordan metabolomer av patogene bakteriearter reagerer på antibiotisk stress og hvordan bakteriearter kan variere som respons på dem. Det har blitt vist at nært beslektede cystisk fibrose -assosierte Burkholderia -arter reagerer på trimetoprim med forskjellige uttrykksnivåer for forskjellige sekundære metabolitter , og fremhever den personlige karakteren av metabolomics i beslektede bakteriestammer.
Forskning fokusert på interbakteriell signalering ved bruk av Burkholderia har vist at kontaktavhengig veksthemming spiller en vesentlig rolle i å formidle celle til celle kommunikasjon spesielt i B. thailandensis . I denne interaksjonen frigjør celler proteintoksiner til omgivelsene, og bare de med et tilsvarende beskyttende protein (vanligvis bakterier av samme stamme) vil ikke få veksten hemmet eller dø. Videre gjennomgår mottakerceller som har det tilsvarende proteinet deretter endringer i genuttrykk og fenotype som fremmer fellesskapsdannelse i form av biofilm . Dette skjer selv om mottakercellen ikke var av samme bakteriestamme som fremhever viktigheten av dette systemet. Genene som koder for proteintoksinene og resten av det kontaktavhengige inhiberingssystemet kan bli mobile i form av et transposon som kan overføre mellom celler og er avgjørende for det kommunale aspektet av systemet. Dermed spiller kontaktavhengig signalisering en betydelig rolle i bakteriell selvgjenkjenning og fellesskapsdannelse.
Burkholderia -arter har vist seg å være en potensiell kilde til fordelaktige produkter som antimikrobielle midler og biosurfaktanter . Sammen med den beslektede slekten Pseudomonas , kan Burkholderia syntetisere en bestemt klasse biosurfaktant som kalles rhamnolipider . Rhamnolipider syntetisert av Burkholderia har forskjellige kjemiske egenskaper (sammenlignet med de syntetisert av Pseudomonas ) og har dermed potensial for nye applikasjoner.
Arter
Liste over arter:
- Burkholderia alpina
- Burkholderia ambifaria
- Burkholderia anthina
- Burkholderia arboris
- Burkholderia cenocepacia
- Burkholderia cepacia
- Burkholderia contaminans
- Burkholderia diffusa
- Burkholderia dolosa
- Burkholderia gladioli
- Burkholderia glumae
- Burkholderia humptydooensis
- Burkholderia lata
- Burkholderia latens
- Burkholderia mallei
- Burkholderia metallica
- Burkholderia multivorans
- Burkholderia oklahomensis
- Burkholderia plantarii
- Burkholderia pseudomallei
- Burkholderia pseudomultivorans
- Burkholderia puraquae
- Burkholderia pyrrocinia
- Burkholderia seminalis
- Burkholderia singaporensis
- Burkholderia singularis
- Burkholderia stabilis
- Burkholderia stagnalis
- Burkholderia territorii
- Burkholderia thailandensis
- Burkholderia ubonensis
- Burkholderia vietnamiensis
Se også
Referanser
Eksterne linker
- Burkholderia genomer og relatert informasjon hos PATRIC , et bioinformatikk ressurssenter finansiert av NIAID
- Pathema- Burkholderia- ressurs
- Burkholderia genomdatabase