Carnegie Mellon University Computational Biology Department - Carnegie Mellon University Computational Biology Department

Beregningsbiologisk avdeling
Beregningsbiologisk avdeling Logo.jpg
Type Privat
Etablert 2007 (som Lane Center for Computational Biology)
plassering
Pittsburgh, Pennsylvania
Campus Urban
Nettsted http://www.cbd.cmu.edu/

The Computational Biology Department (CBD) er en avdeling innenfor School of Computer Science ved Carnegie Mellon University i Pittsburgh , Pennsylvania , USA . Det ligger i Gates-Hillman Center. CBD ble etablert i 2007 av Robert F. Murphy som Lane Center for Computational Biology med finansiering fra Raymond J. Lane og Stephanie Lane, og ble en avdeling på School of Computer Science i 2016.

CBD -fakultet og studenter forsker innen genomikk , systembiologi og biologisk bildebehandling . Fakultetet har fungert som president for National Science Foundation , president for International Society of Advanced Cytometry, og som medlem av National Institutes of Health Council of Councils; de har vunnet priser som Overton Prize , et Guggenheim Fellowship , Okawa Award , en United States Air Force Young Investigator Award og en Presidential Young Investigator Award .

Som en del av HHMI-NIBIB Interfaces Initiative mottok CBD midler fra Howard Hughes Medical Institute og National Institute of Biomedical Imaging and Bioengineering (NIBIB) for å utvikle en tverrfaglig doktorgrad. program i beregningsbiologi med University of Pittsburgh , som ble grunnlagt som Joint CMU-Pitt Ph.D. Program i beregningsbiologi i 2005. Dette programmet mottar for tiden opplæringsstøtte gjennom et National Institutes of Health T32 Training Grant. CBD er hjemmet til BS i databehandlingsbiologi, et av de fire BS -studiene innen Carnegie Mellon School of Computer Science . Utdanningsprogrammet Computational Biology er rangert som et av de 3 beste programmene av US News.

CBD er hjemmet til et NIH Center for HuBMAP Integration, Visualization & Engaging (HIVE) Initiative ledet av Ziv Bar-Joseph og et NIH Center for Multiscale Analysis of 4D Nucleome Structure and Function by Comprehensive Multimodal Data Integration ledet av Jian Ma .

Bemerkelsesverdig fakultet

Bemerkelsesverdige møter vert

  • ANBEFAL 2014
  • Great Lakes Bioinformatics Conference 2013 (sammen med University of Pittsburgh)
  • Automatisert personlig genomanalyse (APGA) 2013
  • Bioimage Informatics 2010

Utdanningsprogrammer

  • Felles CMU-Pitt Ph.D. Program i databehandlingsbiologi (med University of Pittsburgh )
  • MS i databehandlingsbiologi (sammen med Institutt for biologiske vitenskaper)
  • MS i bioteknologi innovasjon og beregning (sammen med Language Technologies Institute )
  • BS i databehandlingsbiologi
  • Mindre i beregningsbiologi

Referanser

  1. ^ (CMU), Carnegie Mellon University. "20. september: Carnegie Mellon etablerer Ray og Stephanie Lane Center for Computational Biology - Carnegie Mellon University" . www.cmu.edu . Hentet 2016-03-14 .
  2. ^ (CMU), Carnegie Mellon University. "22. september: Beregningsbiologi blir avdeling i Carnegie Mellons School of Computer Science - Carnegie Mellon University" . www.cmu.edu . Hentet 2016-03-14 .
  3. ^ "Beregningsmetode fremskynder dramatisk estimater av genuttrykk, CMU, UMD -forskere rapporterer | Carnegie Mellon School of Computer Science" . www.cs.cmu.edu . Hentet 2016-03-15 .
  4. ^ Patro, Rob; Mount, Stephen M .; Kingsford, Carl (2014-05-01). "Seilfisk muliggjør justeringsfri isoformkvantifisering fra RNA-seq-leser ved bruk av lette algoritmer" . Naturbioteknologi . 32 (5): 462–464. arXiv : 1308.3700 . doi : 10.1038/nbt.2862 . ISSN  1087-0156 . PMC  4077321 . PMID  24752080 .
  5. ^ Kanfi, Yariv; Naiman, Shoshana; Amir, Gail; Peshti, Victoria; Zinman, Guy; Nahum, Liat; Bar-Joseph, Ziv; Cohen, Haim Y. (mars 2012). "Sirtuin SIRT6 regulerer levetiden hos hannmus". Natur . 483 (7388): 218–221. Bibcode : 2012Natur.483..218K . doi : 10.1038/nature10815 . PMID  22367546 .
  6. ^ Naik, Armaghan W .; Kangas, Joshua D .; Sullivan, Devin P .; Murphy, Robert F. (2016-02-03). "Aktiv maskinlæringsdrevet eksperiment for å bestemme sammensatte effekter på proteinmønstre" . eLife . 5 : e10047. doi : 10.7554/eLife.10047 . PMC  4798950 . PMID  26840049 .
  7. ^ "Forskernes robotdrevne system kan redusere kostnadene ved å oppdage legemiddel- og målinteraksjoner | Carnegie Mellon School of Computer Science" . www.cs.cmu.edu . Hentet 2016-03-15 .
  8. ^ "Subra Suresh Biografi" . www.nsf.gov . Hentet 2016-03-15 .
  9. ^ "Tidligere presidenter - ISAC -NET" . isac-net.org . Arkivert fra originalen 2016-03-06 . Hentet 2016-03-29 .
  10. ^ "Murphy utnevnt til NIH Council of Councils | Carnegie Mellon School of Computer Science" . www.cs.cmu.edu . Hentet 2016-03-29 .
  11. ^ "Overton-prisen 2012: Ziv Bar-Joseph" . www.iscb.org . Hentet 2016-03-15 .
  12. ^ Carnegie Mellon. "Jian Ma Vinner Guggenheim Fellowship - Nyheter - Carnegie Mellon University" .
  13. ^ "Carbonell vinner Okawa -prisen" . www.scs.cmu.edu . Hentet 2016-03-15 .
  14. ^ "Air Force investerer mer enn 14 millioner dollar for 2010 Young Investigators Research Program" . www.wpafb.af.mil . Arkivert fra originalen 2016-04-13 . Hentet 2016-03-15 .
  15. ^ "NSF Award Search: Award#8351364 - Presidential Young Investigator Award" . www.nsf.gov . Hentet 2016-03-29 .
  16. ^ "HHMI-NIBIB Interfaces Initiative" . HHMI.org . Arkivert fra originalen 2016-03-12 . Hentet 2016-03-14 .
  17. ^ "Institute News: HHMI tildeler 10 millioner dollar for tverrfaglig videreutdanning" . HHMI.org . Hentet 2016-03-14 .
  18. ^ "NIBIB Investerer i tverrfaglig forskerutdanning" . www.nibib.nih.gov . Hentet 2016-03-14 .
  19. ^ "Carnegie Mellon pressemelding: 6. september 2005" . www.cmu.edu . Arkivert fra originalen 9. april 2016 . Hentet 2016-03-14 .
  20. ^ "Prosjektinformasjon - NIH REPORTER - NIH Research Portfolio Online Reporting Tools Utgifter og resultater" . projectreporter.nih.gov . Hentet 2016-03-15 .
  21. ^ a b "BS i Computational Biology | Computational Biology Department" . Beregningsbiologisk avdeling | Carnegie Mellon University . Hentet 2017-02-07 .
  22. ^ "Beste programmer for bioinformatikk/bioteknologi" .
  23. ^ University, Carnegie Mellon. "Carnegie Mellon vil hjelpe til med å bygge 3D -mobilkart over menneskekroppen - Nyheter - Carnegie Mellon University" . www.cmu.edu . Hentet 2021-07-31 .
  24. ^ University, Carnegie Mellon. "Carnegie Mellon leder det nye senteret for å studere strukturen i cellekernen - nyheter - Carnegie Mellon University" . www.cmu.edu . Hentet 2021-07-31 .
  25. ^ "ANBEFAL 2014 - 2-5. April, Pittsburgh, Pennsylvania" . murphylab.web.cmu.edu . Hentet 2016-03-14 .
  26. ^ "HJEM" . www.iscb.org . Hentet 2016-03-14 .
  27. ^ University, Carnegie Mellon. "Automatisert personlig genomanalyse for kliniske rådgivere: utfordringer og løsninger -avdeling for databehandling - Carnegie Mellon University" . cbd.cmu.edu . Arkivert fra originalen 2015-09-06 . Hentet 2016-03-29 .
  28. ^ University, Carnegie Mellon. "Bioimage Informatics 2010 -Computational Biology Department - Carnegie Mellon University" . cbd.cmu.edu . Arkivert fra originalen 2015-03-30 . Hentet 2016-03-14 .
  29. ^ "Felles CMU-Pitt Ph.D.-program i databehandlingsbiologi (CPCB)" . Hentet 2018-03-06 .
  30. ^ University, Carnegie Mellon. "MS i databehandlingsbiologi - Carnegie Mellon University" . www.cmu.edu . Hentet 2016-03-14 .
  31. ^ "Bioteknologisk innovasjon og beregning ved Carnegie Mellon University" . bic.cs.cmu.edu . Arkivert fra originalen 2016-03-09 . Hentet 2016-03-14 .
  32. ^ University, Carnegie Mellon. "Mindre i avdeling for beregningsbiologi -beregningsbiologi - Carnegie Mellon University" . cbd.cmu.edu . Hentet 2016-03-14 .