Liste over programvare for fylogenetisk trevisualisering - List of phylogenetic tree visualization software
Wikipedia -artikkel
Denne listen over fylogenetiske trevisningsprogrammer er en samling av programvareverktøy og webportaler som brukes til å visualisere fylogenetiske trær .
Tilordne en gitt prøve genomisk sekvens av SARS-CoV-2 til sin slekt
Phylo.io
Se og sammenlign opptil 2 trær side om side med interaktive HTML5 -visualiseringer
PhyloExplorer
et verktøy for å lette vurdering og håndtering av fylogenetiske tresamlinger. Gitt en innsamling av forankrede trær, gir PhyloExplorer muligheter for å skaffe statistikk som beskriver samlingen, korrigere ugyldige taxonnavn, trekke ut taksonomisk relevante deler av samlingen ved hjelp av et dedikert spørrespråk og identifisere relaterte trær i TreeBASE -databasen.
PHYLOViZ Online
Nettbasert verktøy for visualisering, fylogenetisk slutning, analyse og deling av minimalt spennende trær
PhyloWidget
se, redigere og publisere fylogenetiske trær online; grensesnitt med databaser
Universell plattform for styring, lagring og analyse av alle typer biologiske data, inkludert tre- og nettverksinferens av sekvensdata
W
Bio :: Phylo
En samling Perl -moduler for manipulering og visualisering av fylogenetiske data. Bio :: Philo er en del av en omfattende pakke med Perl -biologiverktøy
Et visuelt grensesnitt for opensource for Phylip 3.6 -pakken
Alle
1 "Alt" refererer til Microsoft Windows, Apple OSX og Linux; L = Linux, M = Apple Mac, W = Microsoft Windows
Biblioteker
Navn
Språk
Beskrivelse
Sitering
ggtree
R
En R -pakke for trevisualisering og annotering med grafikkgrafikk som støttes
jsPhyloSVG
Javascript
åpen kildekode-javascript-bibliotek for gjengivelse av meget utvidbare, tilpassbare fylogenetiske trær; brukt til Elseviers interaktive trær
PhyD3
Javascript
interaktiv fylogenetisk trevisualisering med numeriske annotasjonsgrafer, med SVG- eller PNG -utgang, implementert i D3.js
phylotree.js
Javascript
phylotree.js er et bibliotek som utvider det populære datavisualiseringsrammeverket D3.js , og er egnet for å bygge JavaScript -applikasjoner der brukere kan se og samhandle med fylogenetiske trær