Nextstrain - Nextstrain
Nextstrain er et samarbeid mellom forskere i Seattle , USA og Basel , Sveits, som gir en samling åpen kildekodeverktøy for å visualisere genetikken bak spredningen av virale utbrudd .
Målet er å støtte folkehelsetiltak og overvåking ved å legge til rette for forståelse av spredning og utvikling av patogener . Nextstrain-plattformen ble startet i 2015. Kode utviklet av Nextstrain gjøres offentlig tilgjengelig via for eksempel github.com og dataene er tilgjengelige og synlige i tilgjengelig form via sidene på nettstedet.
applikasjoner
I følge deres nettsted vedlikeholder Nextstrain-teamet en oppdatert genomisk analyse av hver av de følgende patogenene:
- Fugleinfluensa
- Dengue
- Enterovirus D68
- Meslinger
- Kusma
- SARS-CoV-2
- Sesonginfluensa
- Tuberkulose
- West Nile virus
- Vestafrikansk ebola 2013-16
- Zika
Covid-19-pandemi
Nextstrain og dets resultater har blitt sitert mye under COVID-19- pandemien.
Tildele
I mai 2020 mottok Nextstrain og Trevor Bedford (førsteamanuensis, Fred Hutchinson Cancer Research Center ) en Webby Special Achievement Award for nettverktøyet.
Se også
Referanser
Eksterne linker