Quaranjavirus -Quaranjavirus
| Quaranjavirus | |
|---|---|
.jpg)
|
|
| Cygnet River -virus | |
Virusklassifisering 
|
|
| (uten rangering): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Kongedømme: | Orthornavirae |
| Filum: | Negarnaviricota |
| Klasse: | Insthoviricetes |
| Rekkefølge: | Articulavirales |
| Familie: | Orthomyxoviridae |
| Slekt: | Quaranjavirus |
| Arter | |
Quaranjavirus er en slekt av omhyllede RNA-virus , en av syv slekter i den virus familien Orthomyxoviridae . Den genomet er enkeltkjedet , negativ-sense segmentert RNA , vanligvis med seks segmenter. Slekten inneholder to arter: Johnston Atoll -virus og Quaranfil -virus ; det har blitt foreslått å inneholde arter eller stammer, inkludert Cygnet River -virus, Lake Chad -virus, Tyulek -virus og Wellfleet Bay -virus. Quaranjavirus infiserer hovedsakelig leddyr og fugler ; Fra mars 2015 er Quaranfil quaranjavirus det eneste medlemmet av slekten som har vist seg å infisere mennesker. De Quaranfil og Johnston atollen virus overføres mellom virveldyr av flått , likner medlemmer av Thogotovirus , en annen slekt av Orthomyxoviridae .
Historie
Quaranfil -virus ble først isolert fra mennesker i Egypt i 1953. Johnston Atoll -virus og Tsjadsjovirus ble først isolert fra fugler i henholdsvis 1964 og 1969. I 1989, på grunnlag av utseendet til viruspartiklene under elektronmikroskopet , foreslo HG Zeller og kolleger at de skulle klassifiseres som arenavirus , men dette ble ikke akseptert av International Committee on Taxonomy of Virus (ICTV). I 2009, basert på sekvensdata og strukturen til viruspartiklene, foreslo Rachel Presti og kolleger at de tre virusene skulle klassifiseres som en ny slekt av orthomyxovirus , opprinnelig kalt "Quarjavirus". Flere andre virus har senere blitt foreslått som slektsmedlemmer. Slekten ble formelt foreslått for ICTV i 2012, under navnet "Quaranjavirus", og formelt godkjent av det organet i 2013.
Nomenklatur
Quaranfil -virus er oppkalt etter Quaranfil , en av landsbyene i nærheten av Kairo som viruset ble isolert fra. Den Johnston Atoll viruset er oppkalt etter Johnston Atoll i Stillehavet , også der viruset først ble isolert. Slektsnavnet kombinerer "Quaran", med "ja" for J ohnston A toll.
Virologi
Viruspartikkelen er innhyllet og sfærisk, eggformet eller variabel i form, med en diameter generelt i området 80–120 nm . Viruspartikkelen inneholder omkring ti ribosom -lignende granulater, en funksjon av arenaviruses. Den bærer overflateprojeksjoner som er beskrevet på forskjellige måter som 4–5 nm lange og 10–14 nm i lengde og 4–6 nm i diameter.
Den enkelt-trådet , - RNA- genom er lineær og segmentert, vanligvis med seks segmenter av 0.9-2.4 kb og en total størrelse på omkring 11,5 kb. Wellfleet Bay -viruset har et syvende segment av 519 nukleotider . Genomet koder for seks eller (i Wellfleet Bay -viruset) syv proteiner. PA-, PB1- og PB2 -underenhetene til det trimere RNA -polymeraseenzymet er kodet av de tre største segmentene (1-3), som i andre ortomyxovirus. Segment 5 koder konvolutten glykoprotein (gp). Proteiner med ukjent funksjon er kodet av segmentene 4 og 6, som nylig er foreløpig blitt tildelt henholdsvis det virale nukleoproteinet og matriksproteinet . Segment 7 av Wellfleet Bay -viruset koder for et ekstra protein med ukjent funksjon. Quaranjavirus-glykoproteinet viser ingen likhet med influensavirusglykoproteinene ( hemagglutinin og neuraminidase ), og viser i stedet noen likheter med gp64-glykoproteinet til baculovirus , som infiserer insekter, så vel som glykoproteinet til togotovirus , et slekt med flåttoverført virus eller.
Replikasjonssyklusen til Quaranfil -virus tar rundt 24–36 timer, noe som er sammenlignbart med togotovirus og langsommere enn influensavirus.
Vertssortiment og sykdom
Quaranjavirus infiserer både leddyr og virveldyr . De vanligste leddyr vertene er arter av myke ( Argasidae familie) flått . De fleste medlemmer kan ikke infisere myggcellelinjer i laboratoriet. I 2015 ble flere nye medlemmer av slekten foreslått basert på RNA -sekvenser hentet fra mygg, fluer , andre insekter og Neoscona -edderkoppen .
Akvatiske fugler som hekker i kolonier er de vanligste virveldyrverter, inkludert havsuler , terner og hegre . Cygnet River- og Wellfleet Bay-virus har vært assosiert med en ofte dødelig sykdom hos oppdretts- og villandarter , med symptomer som diaré og sløvhet . De fleste slektsmedlemmene som testes kan infisere mus under laboratorieforhold; de forårsaker alvorlig patologi og er ofte dødelige. Quaranfil -virus er det eneste medlemmet av slekten som har vist seg å infisere mennesker; infeksjon ser vanligvis ut til å være asymptomatisk og har noen ganger blitt rapportert å være forbundet med mild feber.
Arter og stammer
To arter er bekreftet av ICTV , Johnston Atoll -viruset og Quaranfil -viruset . Arten eller stammene Cygnet River -virus, Lake Chad -virus, Tyulek -virus og Wellfleet Bay -virus har også blitt foreslått å tilhøre slekten; tretten ytterligere arter eller stammer som er mest beslektet med Johnston Atoll -viruset ble identifisert fra en rekke leddyr basert på RNA -data.
| Arter/stamme | RNA -segmenter | Diameter (nm) | Vektorer | Vertebrate verter | Fordeling | Ref. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cygnet River | Moskusand | Australia | ||||
| Johnston Atoll | 165–200 | Ornithodoros flått | Kylling , mus | Australasia, Stillehavet | ||
| Tsjadsjøen | Mus , vitellinmasket vevfugl | Afrika | ||||
| Quaranfil | ≥6 | 100 eller 137–156 | Argas flått | Mus , mennesker, sjøfugl | Afrika, Asia | |
| Tyulek | 6 | Argas flått | Asia | |||
| Wellfleet Bay | ≥7 | 90–110 | Almindelig ærfugl | Nord Amerika |
.jpg)
Quaranfil -viruset ble opprinnelig isolert i 1953 fra to barn med mild feber i landsbyene Quaranfil og Sindbis , nær Kairo i Egypt. Antistoffer mot viruset er påvist hos rundt 8% av menneskene som er tatt prøver i området, selv om det ikke er rapportert om flere tilfeller av symptomatisk sykdom. Virusets geografiske område er bredt, også Nigeria og Sør -Afrika i Afrika, og Afghanistan , Irak , Iran , Kuwait og Jemen i Midtøsten og Asia. Viruset har også blitt isolert fra sjøfugl og fra flått, for eksempel den myke kroppen Argas arboreus . Viruset har vist seg å overføres mellom virveldyr ved flått. I laboratoriet forårsaker det alvorlig sykdom hos mus.
Cygnet River og Wellfleet Bay -viruset
Cygnet River -viruset ble isolert i 2010 fra embryonerte egg fra Muscovy and ( Cairina moschate ) fra Cygnet River , Kangaroo Island i Australia. Viruset var assosiert med et utbrudd av alvorlig sykdom hos oppdrettsender.
Wellfleet Bay -viruset ble isolert fra ville vanlige ærfugler ( Somateria mollissima ) som overvintret ved Jeremy Point, Wellfleet Bay i Cape Cod , Massachusetts , USA. Viruset var forbundet med et utbrudd av alvorlig sykdom i 2010, og antas å ha vært en faktor i en rekke lignende utbrudd i 1998–2013.
De to virusene er nært beslektede og kan være stammer av det samme viruset; de er også relatert til Quaranfil -virus .
.jpg)
Lake Chad -virus
Lake Chad -viruset ble isolert i 1969 fra en vitellinmasket vevfugl ( Ploceus vitellinus ) fra Tsjadsjøen i Nigeria , og har ennå ikke blitt isolert andre steder. Viruset forårsaker alvorlig sykdom hos mus under laboratorieforhold. Det er nærmest beslektet med Quaranfil -virus .
Johnston Atoll -virus
Johnston Atoll-viruset ble først isolert i 1964 fra myke Ornithodoros capensis- flått som angrep den brune nøktern ( Anous stolidus ) fra Sand Island, Johnston Atoll , i Stillehavet. Utvalget inkluderer også Hawaii , Australia og New Zealand . Viruset har vist seg å overføres mellom virveldyr ved flått. I laboratoriet forårsaker det alvorlig sykdom hos mus og kyllinger.
Tyulek -virus
Tyulek-virus ble isolert fra myke Argas vulgaris- flått som angriper fugler ved Aksu-elven nær landsbyen Tyulek i Kirgisistan . Viruset er nært beslektet med både Quaranfil- og Johnston Atoll -virus.
Andre formodede stammer
Tretten RNA -sekvenser med 34–40% sekvensidentitet for Johnston Atoll -viruset er identifisert hos insekter og edderkopper i Kina . Antatte verter inkluderer Neoscona Nautica (edderkopp), Atherigona orient (pepper bananflue), Chrysomya megacephala (orientalsk latrine fly), Sarcophaga (kjøtt fluer), Musea domestica (flue), Culex tritaeniorhynchus , C. quinquefasciatus , Anopheles sinensis og Armigeres subalbatus ( mygg), Psychoda alternata ( møllflue ), Hippoboscoidea (luseflue), samt uidentifiserte arter i Tabanidae ( hesteflue ), Gerridae (vannstrider) og Stratiomyidae (soldatflue). Nesten 50 virus assosiert med Orthomyxoviridae ble identifisert i et bredt utvalg av insektverter, etter beregningsvirusscreening av den største insekttranskriptomsamlingen som ble samplet over hele verden. Orthomyxoviridae -relaterte virus ble funnet for første gang i insektverter, for eksempel Raphidioptera , Dermaptera , Archaeognatha , Neuroptera , Phasmatodea , Zygentoma og Lepidoptera . Disse funnene plasserer Quaranjavirus i en parafyletisk posisjon til de andre virusene til Orthomyxoviridae med implikasjoner for taksonomiske evalueringer og virusutvikling .