Husholdningsgen - Housekeeping gene

Denne artikkelen handler om det generelle emnet husholdningsgener. For en liste over husholdningsgener som skal brukes som referansestandard, se referansegener .

I molekylærbiologi , husholdningsgener er vanligvis konstitutive gener som er nødvendige for opprettholdelse av grunn cellulær funksjon, og blir uttrykt i alle celler i en organisme under normale og patofysiologiske betingelser. Selv om noen husholdningsgener uttrykkes med relativt konstante hastigheter i de fleste ikke-patologiske situasjoner, kan uttrykket for andre husholdningsgener variere avhengig av eksperimentelle forhold.

Opprinnelsen til begrepet "husholdningsgen" forblir uklar. Litteratur fra 1976 brukte begrepet for å beskrive spesifikt tRNA og rRNA . For eksperimentelle formål brukes uttrykket for ett eller flere husholdningsgener som et referansepunkt for analyse av ekspresjonsnivåer for andre gener. Nøkkelkriteriet for bruk av et husholdningsgen på denne måten er at det valgte husholdningsgenet uttrykkes jevnt med lav varians under både kontroll- og eksperimentelle forhold. Validering av husholdningsgener bør utføres før bruk i genuttrykseksperimenter som RT-PCR . Nylig en web-basert database med menneskelige og mus housekeeping gener og referanse gener / karakterutskrifter, kalt Housekeeping og Reference Avskrift av Atlas (HRT Atlas), ble utviklet for å tilby oppdatert liste over housekeeping gener og pålitelige kandidat referanse gener / karakterutskrifter for RT-qPCR data normalisering. Denne databasen er tilgjengelig på http://www.housekeeping.unicamp.br .

Husholdningsgenregulering

Husholdningsgener står for flertallet av de aktive genene i genomet, og uttrykket deres er åpenbart avgjørende for overlevelse. Hushjelpsgenuttrykknivåene er finjustert for å møte de metabolske kravene i forskjellige vev. Biokjemiske studier av transkripsjonsstart av husholdningsgenpromotorer har vært vanskelige, delvis på grunn av de mindre karakteriserte promotermotivene og transkripsjonsinitieringsprosessen.

Menneskelige husholdningsgenpromotorer er vanligvis utarmet av TATA -boks, har høyt GC -innhold og høy forekomst av CpG -øyer . I Drosophila, hvor promotorspesifikke CpG-øyer er fraværende, inneholder husholdningsgenpromotorer DNA-elementer som DRE, E-box eller DPE. Transkripsjonsstartsteder for husholdningsgener kan spenne over et område på rundt 100 bp, mens transkripsjonsstartsteder for utviklingsregulerte gener vanligvis er fokusert i et smalt område. Lite er kjent om hvordan den spredte transkripsjonsstart av husholdningsgenet er etablert. Det er transkripsjonsfaktorer som er spesielt beriket på og regulerer husholdningsgenpromotorer. Dessuten er rengjøring promotere reguleres ved rengjøring forsterkere men ikke utviklingsmessig regulert enhancere.

Vanlige husholdningsgener hos mennesker

Følgende er en delvis liste over "husholdningsgener." For en mer komplett og oppdatert liste, se HRT Atlas -databasen utarbeidet av Bidossessi W. Hounkpe et al. Databasen ble konstruert ved å utvinne mer enn 12000 RNA-seq datasett for mennesker og mus.

Genuttrykk

Transkripsjonsfaktorer

Sterol Regulatory Element Binding Protein
  • ATF1 NM_005171
  • ATF2 NM_001880
  • ATF4 Aktivering av transkripsjonsfaktor 4 NM_001675
  • ATF6 NM_007348
  • ATF7 NM_001206682
  • ATF7IP NM_018179
  • BTF3 NM_001207 Homo sapiens grunnleggende transkripsjonsfaktor 3
  • E2F4 Homo sapiens E2F transkripsjonsfaktor 4, p107/p130-binding (E2F4), mRNA
  • ERH (gen) Forsterker av rudimentær homolog av drosophila (som igjen er det første enzymatiske trinnet i pyrimidinsyntese. Regulert av MITF)
  • HMGB1 gruppeboks med høy mobilitet binder DNA
  • ILF2 Homo sapiens interleukin enhancer binding factor 2, 45kDa (ILF2), mRNA
  • IER2 tidligere ETR101 Umiddelbart tidlig protein?
  • JUND Homo sapiens jun D proto-onkogen (JUND), mRNA
  • TCEB2 Elongin Matheo er rar
Repressorer
  • PUF60 Homo sapiens sikringsbindende protein-interagerende repressor (SIAHBP1), transkripsjon

RNA -spleising

Små kjerne-ribonukleoprotein-assosierte proteiner B og B '
  • BAT1 aka DDX39B
  • HNRPD Homo sapiens heterogent kjernefysisk ribonukleoprotein D (AU-rikt element RNA
  • HNRPK Homo sapiens heterogent kjernefysisk ribonukleoprotein K (HNRPK), transkripsjon
  • PABPN1 poly (A) bindende protein, kjernefysisk 1
  • SRSF3 spleisingsfaktor, arginin/ serinrik

Oversettelsesfaktorer

tRNA -syntese
  • AARS NM_001605 alanyl-tRNA syntetase
  • AARS2 NM_020745 alanyl-tRNA synthetase 2, mitokondriell
  • AARSD1 NM_001261434 alanyl-tRNA syntetase domene som inneholder 1
  • CARS NM_001751 cysteinyl-tRNA syntetase
  • CARS2 NM_024537 cysteinyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell (antatt)
  • DARS NM_001349 aspartyl-tRNA syntetase
  • DARS2 NM_018122 aspartyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • EARS2 NM_001083614 glutamyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • FARS2 NM_006567 fenylalanyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • FARSA NM_004461 fenylalanyl-tRNA syntetase, alfa-underenhet
  • FARSB NM_005687 fenylalanyl-tRNA syntetase, beta-underenhet
  • GARS NM_002047 glycyl-tRNA synthetase
  • HARS NM_002109 histidyl-tRNA syntetase
  • HARS2 NM_012208 histidyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • IARS NM_002161 isoleucyl-tRNA synthetase
  • IARS2 NM_018060 isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitokondriell
  • KARS NM_005548 Homo sapiens lysyl-tRNA syntetase (KARS), mRNA
  • LARS2 NM_015340 isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitokondriell
  • MARS NM_004990 metionyl-tRNA syntetase
  • MARS2 NM_138395 metionyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • NARS NM_004539 asparaginyl-tRNA syntetase
  • NARS2 NM_024678 asparaginyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell (antatt)
  • QARS NM_005051 glutaminyl-tRNA syntetase
  • RARS NM_002884 Arginyl- tRNA syntetase
  • RARS2 NM_020320 arginyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • SARS NM_006513 Homo sapiens seryl-tRNA syntetase (SARS), mRNA
  • TARS NM_152295 treonyl-tRNA syntetase
  • VARS2 NM_020442 valyl-tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • WARS2 NM_015836 tryptofanyl tRNA syntetase 2, mitokondriell
  • YARS NM_003680 Homo sapiens tyrosyl-tRNA synthetase (YARS), mRNA
  • YARS2 NM_001040436 Homo sapiens tyrosyl-tRNA synthetase (YARS), mRNA mitokondriell
RNA -bindende protein

Ribosomale proteiner

RPS19BP1

Mitokondriale ribosomale proteiner

RNA -polymerase

Proteinbehandling

  • PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D
  • PPIE Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E
  • PPIF Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F
  • PPIG Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase G
  • PPIH Cyclophilin H
  • CANX Calnexin. Folding av glykoproteiner i endoplasmatisk retikulum
  • CAPN1 Calpain -underenhet
  • CAPN7
  • CAPNS1 Calpain -protease -underenhet
  • NACA Nascent polypeptid -assosiert kompleks alfa -polypeptid
  • NACA2
  • PFDN2 Prefoldin 2
  • PFDN4 Prefoldin 4
  • PFDN5 Prefoldin 5
  • PFDN6 Prefoldin 6
  • SNX2 Sortering av nexin 2
  • SNX3 Sortering av nexin 3
  • SNX4 Sortering av nexin 4
  • SNX5 Sortering av nexin 5
  • SNX6 Sortering av nexin 6
  • SNX9 Sortering av nexin 9
  • SNX12 Sortering av nexin 12
  • SNX13 Sortering av nexin 13
  • SNX17 Sortering av nexin 17
  • SNX18 Sortering av nexin 18
  • SNX19 Sortering av nexin 19
  • SNX25 Sortering av nexin 25
  • SSR1 Translocon-assosiert protein TRAPA. Proteintranslokasjon i ER
  • SSR2 Translocon-assosiert protein TRAPB. Proteintranslokasjon i ER
  • SSR3 Translocon-assosiert protein TRAPG. Proteintranslokasjon i ER
  • SUMO1 Proteinmålretting
  • SUMO3 Proteinmålretting

Varmesjokkproteiner

Histon

Cellesyklus

Det er betydelig overlapping i funksjon med hensyn til noen av disse proteinene. Spesielt er de Rho-relaterte genene viktige i atomhandel (dvs. mitose) så vel som med mobilitet langs cytoskjelettet generelt. Disse genene av spesiell interesse for kreftforskning.

  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGDIA
  • ARHGEF10L Rho guanin nukleotid utvekslingsfaktor 10L
  • ARHGEF11 Rho guanin nukleotid utvekslingsfaktor 11
  • ARHGEF40 Rho guanin nukleotid utvekslingsfaktor 40
  • ARHGEF7 Rho guanin nukleotid utvekslingsfaktor 7
  • RAB10 NM_016131 De små GTPasene Rab er viktige regulatorer for intracellulær membranhandel, fra dannelse av transportvesikler til fusjon med membraner
  • RAB11A NM_004663
  • RAB11B NM_004218
  • RAB14 NM_016322
  • RAB18 NM_021252
  • RAB1A NM_004161 Homo sapiens RAB1A, medlem RAS onkogenfamilie (RAB1A), mRNA
  • RAB1B NM_030981
  • RAB21 NM_014999
  • RAB22A NM_020673
  • RAB2A NM_002858
  • RAB2B NM_001163380
  • RAB3GAP1 NM_012233
  • RAB3GAP2 NM_012414
  • RAB40C NM_021168
  • RAB4A NM_004578
  • RAB5A NM_004162
  • RAB5B NM_002865
  • RAB5C NM_004583
  • RAB6A NM_002868
  • RAB7A NM_004637
  • RAB9A NM_004251
  • RABEP1 NM_004703
  • RABEPK NM_005833
  • RABGEF1 NM_014504
  • RABGGTA NM_004581
  • RABGGTB NM_004582
  • CENPB Centromere protein B
  • CTBP1 Centromere protein T
  • CCNB1IP1 NM_021178 E3 ubiquitin-protein ligase. Modulerer syklin B -nivåer og deltar i reguleringen av cellesyklusprogresjon gjennom G2 -fasen
  • CCNDBP1 NM_012142 Kan regulere cellesyklusens progresjon negativt
  • CCNG1 NM_004060 Kan spille en rolle i vekstregulering
  • CCNH NM_001239 Involvert i cellesykluskontroll og i RNA -transkripsjon av RNA -polymerase II. Uttrykket og aktiviteten er konstant gjennom cellesyklusen
  • CCNK NM_001099402 Regulerende underenhet av syklinavhengige kinaser som medierer fosforylering av den store underenheten til RNA-polymerase II
  • CCNL1 NM_020307 Transkripsjonell regulator som deltar i regulering av pre-mRNA-spleiseprosessen
  • CCNL2 NM_030937 Transkripsjonsregulator som deltar i regulering av pre-mRNA-spleiseprosessen. Modulerer også uttrykket for kritisk apoptotisk faktor, noe som fører til celleapoptose.
  • CCNY NM_145012 Positiv regulatorisk underenhet av de syklinavhengige kinasene CDK14/PFTK1 og CDK16. Fungerer som en cellesyklusregulator for Wnt-signalveien under G2/M-fasen
  • PPP1CA NM_002708 Proteinfosfatase som assosieres med over 200 regulatoriske proteiner for å danne svært spesifikke holoenzymer som defosforylerer hundrevis av biologiske mål
  • PPP1CC NM_002710
  • PPP1R10 NM_002714
  • PPP1R11 NM_021959 Homo sapiens protein fosfatase 1, regulatorisk (hemmer) underenhet 11 (PPP1R11),
  • PPP1R15B NM_032833
  • PPP1R37 NM_019121
  • PPP1R7 NM_002712
  • PPP1R8 NM_002713
  • PPP2CA NM_002715
  • PPP2CB NM_001009552
  • PPP2R1A NM_014225 Negativ regulator for vekst og celledeling Homo sapiens proteinfosfatase 2 (tidligere 2A), regulatorisk underenhet A (PR 65),
  • PPP2R2A NM_002717
  • PPP2R2D NM_018461
  • PPP2R3C NM_017917
  • PPP2R4 NM_021131
  • PPP2R5A NM_006243
  • PPP2R5B NM_006244
  • PPP2R5C NM_002719
  • PPP2R5D NM_006245
  • PPP2R5E NM_006246
  • PPP4C NM_002720
  • PPP4R1 NM_005134
  • PPP4R2 NM_174907
  • PPP5C NM_006247
  • PPP6C NM_002721
  • PPP6R2 NM_014678
  • PPP6R3 NM_018312
  • RAD1Homo sapiens ribonuclease/angiogenin inhibitor (RNH), mRNA
  • RAD17 NM_002869 Viktig for vedvarende cellevekst, opprettholdelse av kromosomal stabilitet og ATR-avhengig kontrollpunktaktivering ved DNA-skade
  • RAD23B NM_002873
  • RAD50 NM_005732
  • RAD51C NM_002874
  • IST1 (lokaliserer til den sentrale skillelinjen for delende celler)

Apoptose

  • DAD1 Forsvarer mot celledød
  • DAP3 Involvert i formidling av interferon-gamma-indusert celledød.
  • DAXX Death Associated Protein 6

Onkogener

DNA -reparasjon/replikasjon

  • MCM3AP muligens en primase
  • XRCC5 NM_021141 Ku80
  • XRCC6 NM_001469 Homo sapiens thyroid autoantigen: Enstrenget DNA-avhengig ATP-avhengig helikase. Har en rolle i kromosomtranslokasjon.

Metabolisme

  • PRKAG1 Føler energinivå og inaktiverer HMGCoA reduktase og Acetyl CoA karboksylase
  • PRKAA1 NM_006251 Katalytisk underenhet av AMP-aktivert proteinkinase (AMPK), en energisensor proteinkinase som spiller en nøkkelrolle i regulering av cellulær energimetabolisme
  • PRKAB1 NM_006253 Ikke-katalytisk underenhet av AMP-aktivert proteinkinase (AMPK), en energisensor proteinkinase som spiller en nøkkelrolle i regulering av cellulær energimetabolisme
  • PRKACA NM_002730 Fosforylerer et stort antall substrater i cytoplasma og kjerne.
  • PRKAG1 NM_002733 Homo sapiens proteinkinase, AMP-aktivert, gamma 1 ikke-katalytisk underenhet (PRKAG1), mRNA
  • PRKAR1A NM_002734 Regulerende underenhet av cAMP-avhengige proteinkinaser involvert i cAMP-signalering i celler
  • PRKRIP1 NM_024653 Binder dobbeltstrenget RNA. Inhiberer EIF2AK2 kinaseaktivitet (ved likhet).

Karbohydratmetabolisme

Sitronsyresyklus

  • SDHA NM_004168 Sukkinatdehydrogenase -underenhet A
  • SDHAF2 NM_017841
  • SDHB NM_002973 Jern-svovelprotein (IP) subenhet av succinat dehydrogenase (SDH) som er involvert i kompleks II i mitokondriell elektrontransportkjede og er ansvarlig for overføring av elektroner fra succinat til ubiquinon (koenzym Q)
  • SDHC NM_003000 Membranforankringsunderenhet av succinat dehydrogenase (SDH) som er involvert i kompleks II i mitokondriell elektrontransportkjede og er ansvarlig for å overføre elektroner fra succinat til ubiquinon (koenzym Q).
  • SDHD NM_003001

Lipidmetabolisme

  • HADHA Trifunksjonell protein -underenhet alfa

Aminosyremetabolisme

NADH dehydrogenase

Cytokrom C oksidase

(Vær oppmerksom på at COX1, COX2 og COX3 er mitokondrielt kodet)

  • COX4I1 001861
  • COX5B NM_001862
  • COX6B1 NM_001863
  • COX6C NM_004374
  • COX7A2 NM_001865 Homo sapiens cytokrom c oksidase underenhet VIIa polypeptid 2 (lever) (COX7A2),
  • COX7A2L NM_004718
  • COX7C NM_001867
  • COX8
  • COX8A NM_004074 Homo sapiens cytokrom c oksidase underenhet VIII (COX8), kjernefysisk koding
  • COX11 NM_004375
  • COX14 NM_032901
  • COX15 NM_004376
  • COX16 NM_016468
  • COX19 NM_001031617
  • COX20 NM_198076
  • CYC1 Homo sapiens cytokrom c-1 (CYC1)
  • UQCC NM_018244 Påkrevd for montering av ubiquinol-cytokrom c reduktasekomplekset (mitokondrie respiratorisk kjede kompleks III eller cytokrom b-c1 kompleks)
  • UQCR10 NM_013387
  • UQCR11 NM_006830 Homo sapiens ubiquinol-cytokrom c reduktase (6,4 kD) underenhet (UQCR), mRNA
  • UQCRB NM_006294
  • UQCRC1 NM_003365 Homo sapiens ubiquinol-cytochrome c reductase core protein I (UQCRC1), mRNA
  • UQCRC2 NM_003366
  • UQCRHL NM_001089591
  • UQCRQ NM_014402 Homo sapiens ubikinonbindende protein med lav molekylær masse (9,5 kD) (QP-C), mRNA

ATPase

  • ATP2C1 NM_014382
  • ATP5A1 NM_004046 Homo sapiens ATP syntase, H+ transport, mitokondrie F1 kompleks, alfa
  • ATP5B NM_001686
  • ATP5C1 NM_005174
  • ATP5D NM_001687 Homo sapiens ATP syntase, H+ transport, mitokondrielt F1 -kompleks, delta
  • ATP5F1 NM_001688
  • ATP5G2 NM_005176
  • ATP5G3 NM_001689 Homo sapiens ATP -syntase, H+ transport, mitokondrielt F0 -kompleks, underenhet c
  • ATP5H NM_006356 Homo sapiens ATP syntase, H+ transport, mitokondrielt F0 -kompleks, underenhet d
  • ATP5J NM_001685
  • ATP5J2 NM_004889 Homo sapiens ATP syntase, H+ transport, mitokondrielt F0 -kompleks, underenhet f,
  • ATP5J2-PTCD1 NM_001198879
  • ATP5L NM_006476
  • ATP5O NM_001697 Homo sapiens ATP -syntase, H+ transport, mitokondrielt F1 -kompleks, O -underenhet
  • ATP5S NM_015684
  • ATP5SL NM_018035
  • ATP6AP1 NM_001183 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomalt interagerende protein 1 (ATP6IP1),
  • ATP6V0A2 NM_012463
  • ATP6V0B NM_004047 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomal 21kDa, V0 subenhet c (ATP6V0B),
  • ATP6V0C NM_001694 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomal 16kDa, V0 subenhet c (ATP6V0C),
  • ATP6V0D1 NM_004691
  • ATP6V0E1 NM_003945
  • ATP6V1C1 NM_001695
  • ATP6V1D NM_015994
  • ATP6V1E1 NM_001696 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomal 31kDa, V1 subenhet E isoform 1
  • ATP6V1F NM_004231 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomal 14kDa, V1 subenhet F (ATP6V1F),
  • ATP6V1G1 NM_004888 Homo sapiens ATPase, H+ transport, lysosomal 13kDa, V1 subenhet G isoform 1
  • ATP6V1H NM_015941
  • ATPAF2 NM_145691
  • ATPIF1 NM_016311

Lysosom

Proteasome

  • PSMA1 NM_002786
  • PSMA2 NM_002787
  • PSMA3 NM_002788
  • PSMA4 NM_002789
  • PSMA5 NM_002790
  • PSMA6 NM_002791
  • PSMA7 NM_002792 Homo sapiens proteasom (prosome, makropain) underenhet, alfatype, 7 (PSMA7),
  • PSMB1 NM_002793 Homo sapiens proteasom (prosome, makropain) underenhet, betatype, 1 (PSMB1), mRNA
  • PSMB2 NM_002794 Homo sapiens proteasom (prosome, makropain) underenhet, betatype, 2 (PSMB2), mRNA
  • PSMB3 NM_002795
  • PSMB4 NM_002796 Homo sapiens proteasom (prosome, makropain) underenhet, betatype, 4 (PSMB4), mRNA
  • PSMB5 NM_002797
  • PSMB6 NM_002798
  • PSMB7 NM_002799 Homo sapiens proteasom (prosome, makropain) underenhet, betatype, 7 (PSMB7), mRNA
  • PSMC2 NM_002803
  • PSMC3 NM_002804
  • PSMC4 NM_006503
  • PSMC5 NM_002805
  • PSMC6 NM_002806
  • PSMD1 NM_002807
  • PSMD10 NM_002814
  • PSMD11 NM_002815 Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S-underenhet, ikke-ATPase, 11
  • PSMD12 NM_002816
  • PSMD13 NM_002817
  • PSMD14 NM_005805
  • PSMD2 NM_002808
  • PSMD3 NM_002809
  • PSMD4 NM_002810
  • PSMD5 NM_005047
  • PSMD6 NM_014814
  • PSMD7 NM_002811
  • PSMD8 NM_002812 Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) 26S-underenhet, ikke-ATPase, 8 (PSMD8),
  • PSMD9 NM_002813
  • PSME2 NM_002818 Homo sapiens proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2 (PA28 beta)
  • PSME3 NM_005789
  • PSMF1 NM_006814
  • PSMG2 NM_020232
  • PSMG3 NM_032302
  • PSMG4 NM_001128591
  • UBA1 NM_003334 Homo sapiens ubiquitin-aktiverende enzym E1 (A1S9T og BN75 temperatur
  • UBA2 NM_005499
  • UBA3 NM_003968
  • UBA5 NM_024818
  • UBA52 NM_003333
  • UBAC2 NM_177967
  • UBALD1 NM_145253
  • UBAP1 NM_016525
  • UBAP2L NM_014847
  • UBB NM_018955 Homo sapiens ubiquitin B (UBB), mRNA
  • UBC NM_021009 Homo sapiens ubiquitin C (UBC), mRNA
  • UBE2A NM_003336
  • UBE2B NM_003337
  • UBE2D2 NM_003339 Homo sapiens ubiquitin-konjugerende enzym E2D 2 (UBC4/5 homolog, gjær)
  • UBE2D3 NM_003340
  • UBE2D4 NM_015983
  • UBE2E1 NM_003341
  • UBE2E2 NM_152653
  • UBE2E3 NM_006357
  • UBE2F NM_080678
  • UBE2G2 NM_003343
  • UBE2H NM_003344
  • UBE2I NM_003345 Homo sapiens ubiquitin-konjugerende enzym E2I (UBC9 homolog, gjær) (UBE2I),
  • UBE2J1 NM_016021
  • UBE2J2 NM_058167
  • UBE2K NM_005339
  • UBE2L3 NM_003347
  • UBE2M NM_003969 Homo sapiens ubiquitin-konjugerende enzym E2M (UBC12 homolog, gjær) (UBE2M),
  • UBE2N NM_003348
  • UBE2NL NM_001012989
  • UBE2Q1 NM_017582
  • UBE2R2 NM_017811
  • UBE2V1 NM_021988
  • UBE2V2 NM_003350
  • UBE2W NM_018299
  • UBE2Z NM_023079
  • UBE3A NM_000462
  • UBE3B NM_130466
  • UBE3C NM_014671
  • UBE4A NM_004788
  • UBE4B NM_006048
  • USP10 NM_005153
  • USP14 NM_005151
  • USP16 NM_006447
  • USP19 NM_006677
  • USP22 NM_015276
  • USP25 NM_013396
  • USP27X NM_001145073
  • USP33 NM_015017
  • USP38 NM_032557
  • USP39 NM_006590
  • USP4 NM_003363
  • USP47 NM_017944
  • USP5 NM_003481
  • USP7 NM_003470
  • USP8 NM_005154
  • USP9X NM_001039590

Ribonuklease

  • RNH Ribonukleasehemmer

Tioreduktase

Strukturell

Cytoskeletal

Organellesyntese

En spesialisert form for cellesignalering

Mitokondrion

Flate

Celleadhesjon

Kanaler og transportører

Reseptorer

HLA/immunglobulin/cellegjenkjenning

Kinaser/signalering

  • ADRBK1 kan nedregulere responsen på adrenalin
  • AGPAT1 acyl 3 fosfoglyserol acyl transferase
  • ARF1
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARL2 RAS Superfamilie
  • CSF1 Kolonistimulerende faktor er ikke høyt uttrykt konstitutivt ved 5-12
  • CSK C-src tyrosinkinase
  • DCT dopakrom tautomerase
  • EFNA3
  • FKBP1A
  • GDI1 BNP Dissosiasjonshemmer (Rab -familien)
  • GNAS1 er allestedsnærværende uttrykt, men differensielt preget
  • GNAI2
  • HAX1 assosiert med tyrosinkinaser
  • ILK Integrin -koblet kinase
  • MAPKAPK2
  • MAP2K2
  • MAP3K11
  • PITPNM Phosphatidylinositol transfer protein
  • RAC1 Ro GTPase er involvert i mange signalveier
  • RAP1B GTPase involvert i celleadhesjon
  • RAGA Ras-relatert GTP-binding
  • STK19
  • STK24 Serine/Threonine Kinase
  • STK25
  • YWHAB Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide
  • YWHAH Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, h polypeptide
  • YWHAQ Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide
  • YWHAZ Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide

Vekstfaktorer

Vevsnekrosefaktor

  • CD40 tidligere TNFRSF5

Kaseinkinase

Diverse

  • ALAS1 Aminolevulinsyre Syntase type 1 (type 2 er erytroid og assosiert med porfyri)
  • ARHGEF2 Rho guanin nukleotid utvekslingsfaktor
  • ARMET Mesencephalic astrocyte-avledet nevrotrofisk faktor
  • AES aminoterminalforsterker av split
  • BECN1 involvert i autofagi og partnere med PI3K
  • BUD31 tidligere Maternal G10 -transkripsjon
  • Kreatinkinase CKB (ATP -reservoar)
  • Cytidindeaminase tvilsomt: ikke til stede i veldig høye nivåer i det hele tatt
  • CPNE1
  • ENSA (gen)
  • FTH1 Tung kjede av Ferritin
  • GDI2 rab/ras vesikulær handel
  • GUK1 Guanylatkinase overfører fosfat fra ATP til GMP
  • HPRT Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase
  • IFITM1 Indusert av interferon, transmembranprotein
  • JTB (gen) Hopp -translokasjonsbruddspunkt
  • MMPL2
  • NME2 (tidligere NM23B) Nukleosiddifosfatkinase
  • NEI NEI
  • P4HB
  • PRDX1 peroxiredoxin (reduserer peroksider)
  • PTMA protymosin
  • RPA2 binder DNA under replikasjon for å holde det rett ut
  • SULT1A3 Sulfatkonjugering (merk: SULT1C er sitert i tidligere litteratur som allestedsnærværende, men dette kan være et eksempel på at forskjellige tagger brukes til å referere til et felles område med 2 nært beslektede gener. Hvis taggen er for kort, kan det være at den ikke er det spesifikk nok til å spesifisere et medlem av en genfamilie fra et annet)
  • SYNGR2 Synaptogyrin (kan delta i vesikeltranslokasjon)
  • Tetratricopeptide , TTC1 small glutamine rich tetratricopeptide

Open_reading_frame

Sæd/testikler

Selv om denne siden er viet til gener som bør uttrykkes allestedsnærværende, er denne delen for gener hvis nåværende navn gjenspeiler deres relative oppregulering i testikler

Se også

Referanser

Eksterne linker