Neomura - Neomura
Neomura er en mulig klade sammensatt av de to livsområdene i Archaea og Eukaryota . Gruppen ble navngitt av Thomas Cavalier-Smith i 2002. Navnet betyr "nye vegger", noe som gjenspeiler hans hypotese om at den utviklet seg fra bakterier , og en av de store endringene var erstatning av peptidoglykan cellevegger med andre glykoproteiner . Fra august 2017 godtas neomuranhypotesen ikke av de fleste arbeidere; molekylære fylogenier antyder at eukaryoter er nærmest i slekt med en gruppe arkaere og utviklet seg fra dem, i stedet for å danne en klade med alle arkeere.
Morfologi
Betraktet som en klade, er Neomura en veldig mangfoldig gruppe, som inneholder alle de flercellede artene, så vel som alle de mest ekstremofile artene, men de har alle visse molekylære egenskaper. Alle neomuraner har histoner som hjelper med kromosomemballasje , og de fleste har introner . Alle bruker molekylet metionin som initiator aminosyre for proteinsyntese (bakterier bruker formylmetionin ). Endelig krever alle de neomurans bruke flere typer RNA -polymerase , mens bakterier bruker bare ett.
Filogeni
Det er flere hypoteser for de fylogenetiske forholdene mellom arkaere og eukaryoter.
Visning med tre domener
Da Carl Woese først publiserte sitt tre-domenes system i 1990, ble det antatt at domenene Bacteria , Archaea og Eukaryota var like gamle og like i slekt på livets tre. Imidlertid begynte visse bevis å tyde på at Eukaryota og Archaea var nærmere knyttet til hverandre enn det som var bakterier. Dette beviset inkluderte vanlig bruk av kolesteroler og proteasomer , som er komplekse molekyler som ikke finnes i de fleste bakterier, noe som førte til slutningen om at livets rot lå mellom bakterier på den ene siden og Archaea og Eukaryota kombinert på den andre siden, dvs. at det var to hovedgrener av livet etter LUCA - Bakterier og Neomura (ikke da kalt dette navnet).
|
|||||||||||||
Scenariet "tre primære domener" (3D) var en av de to hypotesene som ble ansett som plausible i en 2010 -gjennomgang av opprinnelsen til eukaryoter.
Avledet clade -visning
I en avis fra 2002 og påfølgende artikler har Thomas Cavalier-Smith og kolleger kunngjort en hypotese om at Neomura var en klede som var dypt nestet med Eubacteria med Actinobacteria som søstergruppe. Han skrev, "Eukaryoter og arkebakterier danner clade neomura og er søstre, som vist avgjørende av gener som bare er fragmentert i arkebakterier og av mange sekvenstrær. Dette søsterskapet tilbakeviser alle teorier om at eukaryoter oppsto ved å slå sammen en arkebakterie og en α-proteobakterie, som også klarer ikke å redegjøre for mange funksjoner som er delt spesielt av eukaryoter og aktinobakterier. "
Disse inkluderer tilstedeværelsen av kolesteroler og proteasomer i Actinobacteria så vel som i Neomura. Funksjoner av denne kompleksiteten vil neppe utvikle seg mer enn én gang i separate grener, så enten var det en horisontal overføring av de to veiene, eller så utviklet Neomura seg fra denne spesielle grenen av bakterietreet.
LUCA |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
To domener
Allerede i 2010 var den største konkurrenten til scenariet med tre domener for opprinnelsen til eukaryoter "to domener" (2D) -scenariet, der eukaryoter dukket opp fra arkehavet. Oppdagelsen av en stor gruppe i Archaea, Lokiarchaeota , som eukaryoter er mer genetisk lik enn andre arkeere, stemmer ikke overens med Neomura -hypotesen. I stedet støtter den hypotesen om at eukaryoter dukket opp fra en gruppe arkaere:
|
Archaea
|
En studie fra 2016 med 16 universelt konserverte ribosomale proteiner støtter 2D-visningen. Det "nye synet på livets tre" viser eukaryoter som en liten gruppe som er nestet i Archaea, spesielt i TACK -superfilen. Opprinnelsen til eukaryoter forblir imidlertid uløst, og de to domenet og tre domenescenariene forblir levedyktige hypoteser.
Se også
Referanser
Videre lesning
- Cavalier-Smith T (1987). "Opprinnelsen til eukaryote og arkebakterielle celler". Ann. NY Acad. Sci . 503 : 17–54. doi : 10.1111/j.1749-6632.1987.tb40596.x . PMID 3113314 . S2CID 38405158 .
- Cavalier-Smith T (januar 2002). "Den neomuranske opprinnelsen til arkebakterier, den negibakterielle roten til det universelle treet og bakteriell megaklassifisering" . Int. J. Syst. Evol. Mikrobiol . 52 (Pt 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
- Cavalier-Smith T (2006). "Å rote livets tre ved overgangsanalyser" . Biol. Direkte . 1 : 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID 16834776 .
- Skophammer RG, Servin JA, Herbold CW, Lake JA (august 2007). "Bevis for en gram-positiv, eubakteriell rot av livets tre" . Mol. Biol. Evol . 24 (8): 1761–8. doi : 10.1093/molbev/msm096 . PMID 17513883 .
- Cox, CJ; Foster, PG; Hirt, RP; Harris, SR; Embley, TM (10. desember 2008). "Den arkebakterielle opprinnelsen til eukaryoter" (PDF) . Prosedyrer fra National Academy of Sciences . 105 (51): 20356–20361. doi : 10.1073/pnas.0810647105 . PMC 2629343 . PMID 19073919 .
- Cavalier-Smith, T. (2. september 2014). "Den neomuranske revolusjonen og fagotrofiske opprinnelsen til eukaryoter og Cilia i lys av intracellulær samevolusjon og et revidert livets tre" . Cold Spring Harbor -perspektiver i biologi . 6 (9): a016006. doi : 10.1101/cshperspect.a016006 . PMC 4142966 . PMID 25183828 .