Pribnow -boks - Pribnow box
Den Pribnow-boksen (også kjent som Pribnow-boks Schaller ) er en sekvens av TATAAT av seks nukleotider ( tymin , adenin , tymin , etc.) som er en essensiell del av et promoter område på DNA for transkripsjon til å forekomme i bakterier . Det er en idealisert eller konsensus -sekvens - det vil si at den viser den hyppigst forekommende basen på hver posisjon i mange promotorer som er analysert; individuelle promotører varierer ofte fra konsensus på en eller flere stillinger. Det kalles også ofte -10 -sekvensen , fordi den er sentrert omtrent ti basepar oppstrøms fra stedet for initiering av transkripsjon.
Pribnow -boksen har en funksjon som ligner TATA -boksen som forekommer i promotorer i eukaryoter og archaea : den blir gjenkjent og bundet av en underenhet av RNA -polymerase under initiering av transkripsjon. Denne delen av DNA er også det første stedet hvor basepar skilles under prokaryot transkripsjon for å gi tilgang til malstrengen. AT-rikdommen er viktig for å tillate denne separasjonen, siden adenin og tymin er lettere å bryte fra hverandre (ikke bare på grunn av færre hydrogenbindinger, men også på grunn av svakere base-stablingseffekter ).
Det er oppkalt etter David Pribnow og Heinz Schaller .
Sannsynlighet for forekomst av hvert nukleotid i E. coli
T | EN | T | EN | EN | T |
---|---|---|---|---|---|
82% | 89% | 52% | 59% | 49% | 89% |
Se også
Referanser