Sletting (genetikk) - Deletion (genetics)

Sletting på et kromosom

I genetikk er en sletting (også kalt gen -sletting , mangel eller slettingsmutasjon ) (tegn: Δ ) en mutasjon (en genetisk avvik) der en del av et kromosom eller en sekvens av DNA utelates under DNA -replikasjon. Et hvilket som helst antall nukleotider kan slettes, fra en enkelt base til et helt stykke kromosom.

De minste enkeltbaserte deletjonsmutasjonene oppstår ved at en enkelt base blar i mal -DNA, etterfulgt av mal -DNA -strengglidning, inne i DNA -polymerasens aktive sted.

Slettinger kan skyldes feil i kromosomovergang under meiose , som forårsaker flere alvorlige genetiske sykdommer . Slettinger som ikke forekommer i multipler av tre baser kan forårsake et rammeskift ved å endre 3-nukleotidproteinleserammen til den genetiske sekvensen. Slettinger er representative for eukaryote organismer, inkludert mennesker og ikke i prokaryote organismer, for eksempel bakterier.

Årsaker

Årsakene inkluderer følgende:

For at synapsis skal oppstå mellom et kromosom med stor interkalærmangel og en normal fullstendig homolog, må den uparrede regionen til den normale homologen løkke ut av den lineære strukturen i en sletting eller kompensasjonssløyfe .

Typer

Typer sletting inkluderer følgende:

  • Terminal sletting - en sletting som skjer mot slutten av et kromosom.
  • Intercalary/interstitial deletion - en sletting som skjer fra det indre av et kromosom.
  • Microdeletion - en relativt liten mengde sletting (opptil 5Mb som kan inneholde et dusin gener).

Mikro-sletting finnes vanligvis hos barn med fysiske abnormiteter. En stor mengde sletting vil føre til umiddelbar abort (spontanabort).

Effekter

Små slettinger er mindre sannsynlig å være dødelige; store slettinger er vanligvis dødelige - det er alltid variasjoner basert på hvilke gener som går tapt. Noen mellomstore slettinger fører til gjenkjennelige menneskelige lidelser, f.eks. Williams syndrom .

Sletting av et par par som ikke er jevnt delbart med tre, vil føre til en rammeskiftmutasjon , noe som får alle kodonene som oppstår etter slettingen til å bli lest feil under oversettelsen , noe som gir et sterkt endret og potensielt ikke -funksjonelt protein . I kontrast kalles en sletting som er jevnt delelig med tre, en sletting i rammen .

Slettinger er ansvarlige for en rekke genetiske lidelser, inkludert noen tilfeller av mannlig infertilitet , to tredjedeler av tilfeller av Duchenne muskeldystrofi og to tredjedeler av tilfellene av cystisk fibrose (de forårsaket av ΔF508 ). Sletting av en del av den korte armen til kromosom 5 resulterer i Cri du chat syndrom. Sletting av SMN -kodende gen forårsaker spinal muskelatrofi , den vanligste genetiske årsaken til spedbarnsdød.

Nyere arbeid antyder at noen slettinger av sterkt bevarte sekvenser (CONDELs) kan være ansvarlige for de evolusjonære forskjellene som er tilstede blant nært beslektede arter. Slike slettinger hos mennesker, referert til som hCONDELs , kan være ansvarlige for de anatomiske og atferdsforskjellene mellom mennesker, sjimpanser og andre varianter av pattedyr som ape eller aper.

Gjenkjenning

Innføringen av molekylære teknikker i forbindelse med klassiske cytogenetiske metoder har de siste årene forbedret det diagnostiske potensialet for kromosomavvik. Spesielt lover mikroarray-komparativ genomisk hybridisering (CGH) basert på bruk av BAC-kloner en sensitiv strategi for påvisning av DNA-kopienummerendringer på en genomomfattende skala. Oppdagelsesoppløsningen kan være så høy som> 30 000 "bånd", og størrelsen på det detekterte kromosomslettingen kan være så liten som 5–20 kb lang. Andre beregningsmetoder ble valgt for å oppdage slettingsfeil ved DNA-sekvensering, for eksempel profilering av slutt-sekvens .

Se også

Referanser