Serumresponsfaktor - Serum response factor

SRF
Tilgjengelige strukturer PDB Ortologsøk: PDBe RCSB Liste over PDB -ID -koder 1HBX , 1K6O , 1SRS
Identifikatorer
Aliaser	SRF , MCM1, serumresponsfaktor
Eksterne ID -er	OMIM : 600589 MGI : 106658 HomoloGene : 31135 GeneCards : SRF
Genplassering ( menneske ) Chr. Kromosom 6 (menneske) Bånd 6p21.1 Start 43.171.269 bp Slutt 43.181.506 bp
Genplassering ( mus ) Chr. Kromosom 17 (mus) Bånd 17 | 17 C Start 46 548 329 bp Slutt 46.556.175 bp
RNA -ekspresjonsmønster Flere referanseuttrykkdata
Genontologi Molekylær funksjon • proteindimeriseringsaktivitet • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA-bindende transkripsjon aktivatoraktivitet, RNA-polymerase II-spesifikk • GO: 0000983 RNA-polymerase II generell transkripsjonsinitieringsfaktoraktivitet • primær miRNA-binding • transkripsjonsfaktorbinding • GO: 0000980 RNA-polymerase II cis-regulatorisk regionsekvens-spesifikk DNA-binding • proteinhomodimeriseringsaktivitet • serum responselementbinding • kromatinbinding • GO: 0001948 proteinbinding • DNA-binding • sekvensspesifikk DNA-binding • transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II distal forsterkersekvens-spesifikk binding • kromatin-DNA-binding • transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II-kjernepromotor proksimal regionsekvens -spesifikk binding • GO: 0001158 cis-regulatorisk regionsekvens-spesifikk DNA-binding • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-binding transkripsjonsfaktor ac tivitet, RNA-polymerase II-spesifikk • histondeacetylase-binding • RNA-polymerase II-spesifikk DNA-bindende transkripsjonsfaktorbinding Mobil komponent • cytoplasma • kjerne • nukleoplasma Biologisk prosess • dorsal aorta morfogenese • utvikling av bronkus brusk • muskelcelle homeostase • utvikling av glatt muskulatur i lungene • regulering av vanntap via hud • transkripsjon av RNA polymerase II • stressfibersamling • cellemigrasjon involvert i spiring angiogenese • blodplateaktivering • hjerte myofibril samling • hjertesløyfing • cellulær aldring • ansiktsutvikling • regulering av celleadhesjon • langsiktig synaptisk depresjon • utvikling av nevronprosjekter • morfogenese av et epitelark • positiv regulering av filopodiumsammensetning • primitiv strekkdannelse • cellulær respons på glukosestimulering • negativ regulering av celle populasjonsspredning • respons på cytokin • regulering av transkripsjon, DNA-templat • dannelse av hjerte-trabekula • aktinfilamentorganisasjon • utvikling av thymus • angiogenese involvert i sårheling • dannelse av blodplater • utvikling av nevroner • i fosterutvikling i embryo • transkripsjon, DNA-templat • positiv regula transkripsjon, DNA-mønstret • hjerteutvikling • positiv regulering av celledifferensiering • forgrening involvert i blodkarets morfogenese • positiv regulering av aksonforlengelse • positiv regulering av glattmuskelkontraksjon • utvikling av luftrørbrusk • respons på giftig stoff • positiv regulering av pri -miRNA-transkripsjon av RNA-polymerase II • positiv regulering av transkripsjon med glukose • regulering av differensiering av glatte muskelceller • vedlikehold av epitelstruktur • assosiativ læring • hudmorfogenese • positiv regulering av DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet • epitelcelle-celleadhesjon • nevronmigrasjon • positiv regulering av transkripsjon initiering av RNA-polymerase II-promotoren • øyelokk utvikling i kameratypen øye • skjoldbruskkjertelen utvikling • negativ regulering av amyloid-beta klaring • negativ regulering av cellemigrering • utviklings vekst • stamcelledifferensiering • gastrulation • troph ektodermal celledifferensiering • positiv tymisk T-celleseleksjon • respons på hormon • cellematriseadhesjon • sarkomerorganisasjon • aktinkytoskjelettorganisasjon • megakaryocyttutvikling • respons på hypoksi • positiv regulering av transkripsjon via serumresponselementbinding • lungemorfogenese • mesodermdannelse • hjerte vaskulær differensiering av glattmuskelceller • mRNA-transkripsjon av RNA-polymerase II • utvikling av multicellulær organisme • tangential migrasjon fra subventrikulær sone til luktpære • positiv regulering av transkripsjon fra RNA-polymerase II-promotor involvert i myokardial forløpercelledifferensiering • langtidsminne • kontraktil aktinfilamentbuntmontering • bicellulær tett kryssenhet • leukocyttdifferensiering • hippocampusutvikling • positiv regulering av transkripsjon med RNA-polymerase II • erytrocytutvikling • negativ regulering av pri-miRNA-transkripsjon av RNA-polymerase II • utvikling av forhjerne ent • cell-celleadhesjon Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
Arter	Menneskelig	Mus
Entrez	6722	20807
Ensembl	ENSG00000112658	ENSMUSG00000015605
UniProt	P11831	Q9JM73
RefSeq (mRNA)	NM_003131 NM_001292001	NM_020493
RefSeq (protein)	NP_001278930 NP_003122 NP_003122.1	NP_065239
Beliggenhet (UCSC)	Chr 6: 43,17 - 43,18 Mb	Chr 17: 46,55 - 46,56 Mb
PubMed søk
Wikidata
Se/rediger Human Se/rediger mus

Serumresponsfaktor , også kjent som SRF , er et transkripsjonsfaktorprotein .

Funksjon

Serumresponsfaktor er medlem av MADS ( M CM1, A gamous, D eficiens og S RF) -boksfamilien til transkripsjonsfaktorer. Dette proteinet binder seg til serumresponselementet (SRE) i promotorregionen til målgener. Dette proteinet regulerer aktiviteten til mange umiddelbare tidlige gener , for eksempel c-fos , og deltar derved i cellesyklusregulering , apoptose , cellevekst og celledifferensiering . Dette genet er nedstrøms mål for mange veier; for eksempel den mitogenaktiverte proteinkinasebanen (MAPK) som virker gjennom de ternære komplekse faktorene (TCF).

SRF er viktig under utviklingen av embryoet, ettersom det har vært knyttet til dannelsen av mesoderm . Hos det fullt utviklede pattedyret er SRF avgjørende for veksten av skjelettmuskulatur. Interaksjon av SRF med andre proteiner, for eksempel steroidhormonreseptorer , kan bidra til regulering av muskelvekst av steroider . Interaksjon av SRF med andre proteiner som myokardin eller Elk-1 kan forbedre eller undertrykke ekspresjon av gener som er viktige for vekst av vaskulær glatt muskel.

Klinisk signifikans

Mangel på hud SRF er forbundet med psoriasis og andre hudsykdommer.

Interaksjoner

Serumresponsfaktor har vist seg å samhandle med:

Se også

• MKL1
• Kjernefysiske aktinfunksjoner

Referanser

Videre lesning

Eksterne linker

• Serum+respons+faktor ved US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• Faktorbok SRF

Denne artikkelen inneholder tekst fra United States National Library of Medicine  ( [1] ), som er i offentlig regi .