IRF8 - IRF8

IRF8
Identifikatorer
Aliaser	IRF8 , H-ICSBP, ICSBP, ICSBP1, IMD32A, IMD32B, IRF-8, interferon regulatorisk faktor 8
Eksterne ID-er	OMIM : 601565 MGI : 96395 HomoloGene : 1629 GenCards : IRF8
Gensted ( menneskelig )
Chr.	Kromosom 16 (menneske)
Slutt	85.922.606 bp
Genplassering ( mus )
Chr.	Kromosom 8 (mus)
Slutt	120.756.694 bp
RNA-ekspresjon mønster
	Flere referanseuttrykksdata
Genontologi
Molekylær funksjon	• DNA-binding ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet ; • GO: 0001948 proteinbinding ; • transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II distal enhancer sekvens-spesifikk binding ; • RNA-polymerase II-transkripsjon regulatorisk region sekvens-spesifikk DNA-binding ; • GO: 0000980 RNA-polymerase II cis-regulatorisk region sekvens-spesifikk DNA-binding ; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 DNA-bindende transkripsjons-repressoraktivitet, RNA-polymerase II-spesifikk ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II-spesifikk;
Mobilkomponent	• cytosol ; • nukleoplasma ; • kjerne ; • cytoplasma;
Biologisk prosess	• myeloid celledifferensiering ; • regulering av transkripsjon, DNA-malet ; • respons på bakterie ; • positiv regulering av interleukin-12 produksjon ; • interferon-gamma-mediert signalvei ; • positiv regulering av interferon-gammaproduksjon ; • positiv regulering av transkripsjonsinitiering fra RNA polymerase II promotor ; • transkripsjon, DNA-mal ; • positiv regulering av transkripsjon, DNA-mal ; • forsvarsrespons mot bakterie ; • type I interferonsignalvei ; • immunrespons ; • fagocytose ; • cellulær respons på lipopolysakkarid ; • forsvarsrespons mot protozo ; • negativ regulering av transkripsjon av RNA-polymerase II ; • positiv regulering av transkripsjon av RNA-polymerase II ; • cellulær respons på interferon-gamma ; • autofagi ; • immunsystemprosess;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	3394
	15900
	ENSG00000140968
	ENSMUSG00000041515
	Q02556
	P23611
	NM_002163 ; NM_001363907 ; NM_001363908
	NM_001301811 ; NM_008320
	NP_002154 ; NP_001350836 ; NP_001350837
	NP_001288740 ; NP_032346
	Wikidata
Vis / rediger menneske	Vis / rediger musen

Interferon regulatorisk faktor 8 (IRF8) også kjent som interferon konsensus sekvens-bindende protein (ICSBP), er et protein som hos mennesker er kodet av IRF8 genet . IRF8 er en transkripsjonsfaktor som spiller kritiske roller i regulering av linjen engasjement og i myeloide cellemodning inkludert beslutningen om en felles myeloid progenitor (CMP) for å differentiate inn i en monocytt -forløper celle.

Funksjon

Interferon Consensus Sequence-binding protein (ICSBP) er en transkripsjonsfaktor av interferon regulatorisk faktor ( IRF ) -familien. Proteiner av denne familien er sammensatt av et konservert DNA-bindende domene i den N-terminale regionen og en divergerende C-terminal region som fungerer som det regulatoriske domenet. IRF-familieproteinene binder seg til det IFN-stimulerte responselementet (ISRE) og regulerer ekspresjon av gener stimulert av type I IFN, nemlig IFN-α og IFN-β . IRF-familieproteiner kontrollerer også ekspresjon av IFN-α og IFN-β-regulerte gener som er indusert av virusinfeksjon.

Knockout studier

IFN-produserende celler (mIPCs) var fraværende i alle lymfoide organer fra ICSBP knockout (KO) mus, som avslørt av mangel på CD11c ^lave B220 ⁺ Ly6C ⁺ CD11b ^- celler. Parallelt klarte CD11c ⁺ -celler isolert fra ICSBP KO-milter ikke å produsere IFN-er av type I som respons på virusstimulering. ICSBP KO-mus viste også en markant reduksjon av DC-undergruppen som uttrykker CD8alpha-markøren (CD8alpha ⁺ DCs) i milt, lymfeknuter og thymus. Videre utviste ICSBP-mangelfulle CD8alpha ⁺ DCs en markert svekket fenotype sammenlignet med WT DCs. De uttrykte svært lave nivåer av costimulatory molekyler (intercellular adhesjonsmolekyl ICAM1 , CD40 , CD80 , CD86 ) og av T-celleområdet-homing chemokine reseptor CCR7 .

Klinisk signifikans

I myeloide celler regulerer IRF8 ekspresjonen av Bax og Fas for å regulere apoptose . I kronisk myelogen leukemi (CML) regulerer IRF8 syre ceramidase for å formidle CML apoptose.

IRF8 er sterkt uttrykt i myeloide celler og ble opprinnelig identifisert som en kritisk avstamningsspesifikk transkripsjonsfaktor for myeloide celledifferensiering, nyere studier har imidlertid vist at IRF8 også er konstitutivt uttrykt i ikke- hematopoietiske kreftceller, om enn på et lavere nivå . Videre kan IRF8 også oppreguleres av IFN-γ i ikke-hemotopoietiske celler. IRF8 formidler uttrykk for Fas, Bax, FLIP , Jak1 og STAT1 for å formidle apoptose i ikke-hemotopoietiske kreftceller.

Analyse av humane kreftgenom databasen viste at IRF8 er ikke vesentlig fokalt forsterkes over hele datasettet fra 3131 svulster, men er betraktelig fokalt slettet på tvers av hele datasettet fra 3131 svulster, noe som tyder på at IRF8 er potensielt en tumor suppressor hos mennesker. Molekylær analyse indikerte at IRF8 genpromoteren er hypermethylated i humane colon carcinoma- celler, noe som tyder på at disse celler kan bruke DNA-metylering for å dempe IRF8 uttrykk for å fremme sykdommen.

Interaksjoner

IRF8 har vist seg å samhandle med IRF1 og COPS2 .

Se også

Interferon regulatoriske faktorer

Referanser

Illustrasjoner

Videre lesning

Weisz A, Marx P, Sharf R, Appella E, Driggers PH, Ozato K, Levi BZ (1993). "Human interferon-konsensus-sekvensbindende protein er en negativ regulator av forsterkningselementer som er felles for interferon-induserbare gener" . J. Biol. Chem . 267 (35): 25589–96. doi : 10.1016 / S0021-9258 (19) 74081-2 . PMID 1460054 .
Sharf R, Azriel A, Lejbkowicz F, Winograd SS, Ehrlich R, Levi BZ (1995). "Funksjonell domeneanalyse av interferon konsensus sekvens bindende protein (ICSBP) og dets tilknytning til interferon regulatoriske faktorer" . J. Biol. Chem . 270 (22): 13063–9. doi : 10.1074 / jbc.270.22.13063 . PMID 7768900 .
Holtschke T, Löhler J, Kanno Y, Fehr T, Giese N, Rosenbauer F, Lou J, Knobeloch KP, Gabriele L, Waring JF, Bachmann MF, Zinkernagel RM, Morse HC, Ozato K, Horak I (1996). "Immunmangel og kronisk myelogen leukemilignende syndrom hos mus med en målrettet mutasjon av ICSBP-genet" . Celle . 87 (2): 307–17. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81348-3 . PMID 8861914 . S2CID 18065448 .
Schaper F, Kirchhoff S, Posern G, Köster M, Oumard A, Sharf R, Levi BZ, Hauser H (1998). "Funksjonelle domener av interferon regulatorisk faktor I (IRF-1)" . Biochem. J . 335 (1): 147–57. doi : 10.1042 / bj3350147 . PMC 1219763 . PMID 9742224 .
Li W, Nagineni CN, Ge H, Efiok B, Chepelinsky AB, Egwuagu CE (1999). "Interferon konsensus sekvens-bindende protein er konstitutivt uttrykt og differensielt regulert i den okulære linsen" . J. Biol. Chem . 274 (14): 9686–91. doi : 10.1074 / jbc.274.14.9686 . PMID 10092656 .
Li W, Nagineni CN, Hooks JJ, Chepelinsky AB, Egwuagu CE (1999). "Interferon-gamma-signalering i humane retinalpigmentepitelceller formidlet av STAT1, ICSBP og IRF-1 transkripsjonsfaktorer". Investere. Oftalmol. Vis. Sci . 40 (5): 976–82. PMID 10102295 .
Rehli M, Poltorak A, Schwarzfischer L, Krause SW, Andreesen R, Beutler B (2000). "PU.1 og interferon konsensus sekvens-bindende protein regulerer myeloide ekspresjon av det humane toll-lignende reseptor 4 genet" . J. Biol. Chem . 275 (13): 9773–81. doi : 10.1074 / jbc.275.13.9773 . PMID 10734131 .
Cohen H, Azriel A, Cohen T, Meraro D, Hashmueli S, Bech-Otschir D, Kraft R, Dubiel W, Levi BZ (2001). "Interaksjon mellom interferon konsensus sekvens-bindende protein og COP9 / signalosom underenhet CSN2 (Trip15). En mulig kobling mellom interferon regulatorisk faktor signalering og COP9 / signalosom" . J. Biol. Chem . 275 (50): 39081–9. doi : 10.1074 / jbc.M004900200 . PMID 10991940 .
Nehyba J, Hrdlicková R, Burnside J, Bose HR (2002). "En ny interferon regulatorisk faktor (IRF), IRF-10, har en unik rolle i immunforsvar og er indusert av v-Rel oncoprotein" . Mol. Celle. Biol . 22 (11): 3942–57. doi : 10.1128 / MCB.22.11.3942-3957.2002 . PMC 133824 . PMID 11997525 .
Zhu C, Saberwal G, Lu Y, Platanias LC, Eklund EA (2005). "Interferon-konsensus-sekvensbindende protein aktiverer transkripsjon av genet som koder for neurofibromin 1" . J. Biol. Chem . 279 (49): 50874–85. doi : 10.1074 / jbc.M405736200 . PMID 15371411 .
Liu J, Guan X, Tamura T, Ozato K, Ma X (2005). "Synergistisk aktivering av interleukin-12 p35-gentranskripsjon av interferon regulatorisk faktor-1 og interferon konsensus sekvens-bindende protein" . J. Biol. Chem . 279 (53): 55609–17. doi : 10.1074 / jbc.M406565200 . PMID 15489234 .
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (2005). "Kartlegging med høy gjennomstrømning av et dynamisk signalnettverk i pattedyrceller". Vitenskap . 307 (5715): 1621–5. Bibcode : 2005Sci ... 307.1621B . doi : 10.1126 / science.1105776 . PMID 15761153 . S2CID 39457788 .
Xiong H, Li H, Kong HJ, Chen Y, Zhao J, Xiong S, Huang B, Gu H, Mayer L, Ozato K, Unkeless JC (2005). "Ubiquitin-avhengig nedbrytning av interferon regulatorisk faktor-8 mediert av Cbl nedregulerer interleukin-12 uttrykk" . J. Biol. Chem . 280 (25): 23531–9. doi : 10.1074 / jbc.M414296200 . PMID 15837792 .
Zhao J, Kong HJ, Li H, Huang B, Yang M, Zhu C, Bogunovic M, Zheng F, Mayer L, Ozato K, Unkeless J, Xiong H (2006). "IRF-8 / interferon (IFN) konsensus sekvens-bindende protein er involvert i Toll-like reseptor (TLR) signalering og bidrar til krysspraten mellom TLR og IFN-gamma signalveier" . J. Biol. Chem . 281 (15): 10073–80. doi : 10.1074 / jbc.M507788200 . PMID 16484229 .
Huang W, Saberwal G, Horvath E, Zhu C, Lindsey S, Eklund EA (2006). "Leukemi-assosierte, konstitutivt aktive mutanter av SHP2-protein-tyrosinfosfatase hemmer NF1-transkripsjonsaktivering av interferon-konsensus-sekvensbindende protein" . Mol. Celle. Biol . 26 (17): 6311–32. doi : 10.1128 / MCB.00036-06 . PMC 1592828 . PMID 16914719 .
Dimberg A, Kårehed K, Nilsson K, Oberg F (2006). "Inhibering av monocytisk differensiering ved fosforyleringsmangel Stat1 er assosiert med nedsatt ekspresjon av Stat2, ICSBP / IRF8 og C / EBPepsilon" . Scand. J. Immunol . 64 (3): 271–9. doi : 10.1111 / j.1365-3083.2006.01827.x . PMID 16918696 .
Leonard D, Svenungsson E, Sandling JK, Berggren O, Jönsen A, Bengtsson C, Wang C, Jensen-Urstad K, Granstam SO, Bengtsson AA, Gustafsson JT, Gunnarsson I, Rantapää-Dahlqvist S, Nordmark G, Eloranta ML, Syvänen AC, Rönnblom L (2013). "Koronar hjertesykdom i systemisk lupus erythematosus er assosiert med interferon regulatorisk faktor 8 genvarianter" . Circ. Kardiovaskulær. Genet . 6 (3): 255–63. doi : 10.1161 / CIRCGENETICS.113.000044 . PMID 23661672 .
Peng YB, Yerle M, Liu B (2007). "Kartlegging av ni gener fra grisinterferon regulatoriske faktorer". Anim. Genet . 37 (6): 600–1. doi : 10.1111 / j.1365-2052.2006.01525.x . PMID 17121613 .
Huang W, Horvath E, Eklund EA (2007). "PU.1, interferon regulatorisk faktor (IRF) 2, og interferon konsensus sekvens-bindende protein (ICSBP / IRF8) samarbeider om å aktivere NF1 transkripsjon i differensierende myeloide celler" . J. Biol. Chem . 282 (9): 6629–43. doi : 10.1074 / jbc.M607760200 . PMID 17200120 .
Mattei F, Schiavoni G, Borghi P, Venditti M, Canini I, Sestili P, Pietraforte I, Morse HC, Ramoni C, Belardelli F, Gabriele L (2006). "ICSBP / IRF-8 regulerer differensielt antigenopptak under dendritisk celleutvikling og påvirker antigenpresentasjon for CD4 + T-celler". Blod . 108 (2): 609–617. doi : 10.1182 / blod-2005-11-4490 . PMID 16569763 .
Schiavoni G, Mattei F, Sestili P, Borghi P, Venditti M, Morse HC, Belardelli F, Gabriele L (2002). "ICSBP er viktig for utvikling av interferonproduserende celler av mus type I og for generering og aktivering av CD8alpha (+) dendritiske celler" . J. Exp. Med . 196 (11): 1415–1425. doi : 10.1084 / jem.20021263 . PMC 2194263 . PMID 12461077 .

Eksterne linker

IRF8 + protein, + menneske ved US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Denne artikkelen inneholder tekst fra United States National Library of Medicine , som er offentlig .

Languages

In other projects