SARS-CoV-2 Theta-variant- SARS-CoV-2 Theta variant

Del av en serie om
Covid-19-pandemi
COVID-19 (sykdom) SARS-CoV-2 (virus) Saker Dødsfall
Tidslinje 2019 2020 januar svar februar svar mars svar april svar Kan svar juni svar juli svar august svar september svar oktober svar november svar desember svar 2021 januar svar februar svar mars svar april svar Kan svar juni svar juli svar august svar september svar oktober svar
Steder Etter land og territorium Afrika Antarktis Asia Europa Nord Amerika Oseania Sør Amerika Ved transport Cruiseskip Sjøskip
Internasjonal respons Evakueringer Ansiktsmasker Internasjonal bistand Undersøkelser av opprinnelse Lockdowns Feilinformasjon Av regjeringer Kina OSS Falske behandlinger Protester OSS Programvare Reisebegrensninger forente nasjoner Verdens Helseorganisasjon WTO IP dispensasjon Undertelling av dødsfall Nasjonale svar Afrika Ghana Den Europeiske Union Tyskland India New Zealand Nigeria Filippinene Russland Sverige Storbritannia Myndighetene OSS føderal regjering Vietnam
Medisinsk respons Sykdomstesting Breathalyzer Utvikling Legemiddelutvikling Repurponering av medisiner Vaksiner Historie Forskning VITT Utplassering Autorisasjoner Operation Warp Speed Feilinformasjon og nøling OSS Vaksinekort Vaksinepass Bharat Biotech CanSino Janssen Moderna Oxford – AstraZeneca Pfizer - BioNTech Sinofarm Sinovac Sputnik V Zydus Cadila
Varianter Alpha Beta Gamma Delta Epsilon Zeta Eta Theta Iota Kappa Lambda Mu Klynge 5 Avstamning B.1.617 Variant av bekymring
Økonomisk innvirkning og lavkonjunktur Kunst og kultur Luftfart Cannabis Kino filmer Disney arrangementer Mote Finansmarkedene Mat industri Kanadisk kjøtt Amerikansk kjøtt Matsikkerhet Journalistikk Musikk Scenekunst Detaljhandel Sport Irland Filippinene Fjernsyn OSS programmer Turisme Videospill Etter land Canada India Irland Malaysia New Zealand Russland Storbritannia OSS
Virkninger Dyr Svarte mennesker Forbrytelse Irland Dødeligheten etter land Uførhet Vold i hjemmet Nødevakueringer utdanning Ghana Irland Storbritannia OSS Miljø Sykehus Språk LHBT -fellesskap Langtidspleie Mental Helse Symptomer Migrasjon Militær Bemerkelsesverdige dødsfall Sør-Afrika Andre helseproblemer Politikk Irland Malaysia Russland Protester Svangerskap Fengsler Religion katolsk kirke Hajj Vitenskap og teknologi Samfunn Irland Malaysia New Zealand Russland Storbritannia OSS Streik Fremmedfrykt og rasisme
COVID-19 portal
v t e

Theta-varianten , også kjent som avstamning P.3 , er en av variantene av SARS-CoV-2 , viruset som forårsaker COVID-19 . Varianten ble først identifisert på Filippinene 18. februar 2021, da to mutasjoner av bekymring ble oppdaget i Central Visayas . Det ble oppdaget i Japan 12. mars 2021, da en reisende fra Filippinene ankom Narita internasjonale lufthavn i Tokyo .

Det er forskjellig fra de som først ble oppdaget i Storbritannia, Sør -Afrika og Brasil, og antas å utgjøre en lignende trussel. Varianten er mer motstandsdyktig mot nøytraliserende antistoffer , inkludert de som er oppnådd gjennom vaksinasjon, som hvordan de sørafrikanske og brasilianske variantene ser ut til å være.

Under den forenklede navngivningsordningen foreslått av Verdens helseorganisasjon , har P.3 blitt merket Theta -variant , og regnes som en variant av interesse (VOI), men ennå ikke en variant av bekymring .

Fra juli 2021 blir Theta ikke lenger ansett som en variant av interesse av WHO.

Klassifisering

Navngivning

17. mars 2021 fikk Public Health England (PHE) navnet Lineage P.3 VUI-21MAR-02 .

1. juni 2021 utnevnte Verdens helseorganisasjon (WHO) avstamning P.3 som Theta -variant.

Mutasjoner

• 

  Aminosyremutasjoner av SARS-CoV-2 Theta-variant plottet på et genomkart over SARS-CoV-2 med fokus på piggen.

Totalt 14 aminosyreutskiftninger ble observert i alle prøver (merket med rødt nedenfor), inkludert syv piggproteinmutasjoner . Blant piggproteinmutasjonene har fire tidligere vært assosiert med bekymringslinjer (dvs. E484K, N501Y, D614G og P681H) mens tre ytterligere erstatninger ble observert mot den C-terminale regionen av proteinet (dvs. E1092K, H1101Y og V1176F). Interessant nok ble det også funnet en enkelt aminosyreerstatning ved N-terminalen til ORF8 (dvs. K2Q) i alle prøvene. Tre andre mutasjoner ble sett i 32 av de 33 prøvene (merket med grønt ), inkludert en sletting av tre aminosyrer ved piggproteinposisjonene 141 til 143. Til slutt ble det også påvist fem synonyme mutasjoner (merket med grått ) i alle tilfellene .

Mutasjonsprofil for Theta Variant

Gene	Aminosyre
ORF1ab	F924F
	D1554G
	S2433S
	L3201P
	D3681E
	N3928N
	L3930F
	P4715L
	A5692V
S	LGV141_143del
	E484K
	N501Y
	G593G
	D614G
	P681H
	S875S
	E1092K
	H1101Y
	V1176F
ORF8	K2Q
N	R203K
	G204R

Karakteristiske mutasjoner av Theta Variant

Gene	Aminosyre
ORF1a	D1554G
	S2625F
	D2980N
	L3201P
	D3681E
	L3930F
ORF1b	P314L
	L1203F
	A1291V
S	LGV141_143del
	E484K
	N501Y
	G593G
	D614G
	P681H
	S875S
	E1092K
	H1101Y
	V1176F
ORF8	K2Q
N	R203K
	G204R

Historie

18. februar 2021 bekreftet Department of Health of the Philippines at det ble påvist to mutasjoner av COVID-19 i Central Visayas etter at prøver fra pasienter ble sendt for å gjennomgå genom-sekvensering. Mutasjonene ble senere navngitt som E484K og N501Y, som ble oppdaget i 37 av 50 prøver, med begge mutasjonene forekommende i 29 av disse. Det var ingen offisielle navn på variantene, og hele sekvensen var ennå ikke identifisert.

12. mars 2021 oppdaget Japan varianten på en reisende fra Filippinene.

13. mars 2021 bekreftet Helsedepartementet at mutasjonene utgjorde en ny variant, som ble betegnet som avstamning P.3. Samme dag bekreftet det også sitt første tilfelle av avstamning P.1 i landet. Selv om avstamningene P.1 og P.3 stammer fra samme avstamning B.1.1.28, sa avdelingen at effekten av avstamning P.3 på vaksinens effekt og smittbarhet ennå ikke er fastslått.

17. mars 2021 bekreftet Storbritannia de to første tilfellene der Public Health England (PHE) kalte det VUI-21MAR-02.

30. april 2021 oppdaget Malaysia 8 tilfeller av avstamning P.3 i Sarawak .

Statistikk

Saker etter land (per 16. oktober 2021)

Land	Bekreftede tilfeller
	PANGOLIN	utbrudd.info	Regeneron	Andre kilder
Filippinene	248	298	298	461
forente stater	17	17	17
Tyskland	11	11	11
Malaysia	10	10	10	1. 3
Storbritannia	9	9	9	10
Japan	7	8	8
Nederland	7	7	7	4
Canada	5	5	5
Australia	3	4	4
Belgia	3	3	3
Kina	3	14	18
Guam	3	3	3
New Zealand	3	3	3
Norge	3	3	3
Singapore	3	3	3
Angola	2	2	2
Sør-Korea	2	2	2
Sverige	2	2	2
Finland	1	1	1
Italia	-	-	1
Total:	342	405	410	488

Se også

Merknader

Referanser

Eksterne linker

• PANGO -avstamninger: Ny variantrapport - Rapport om global distribusjon av avstamning B.1.1.7
• GISAID sekvenseringsdatabase-Sporing av COVID-19-varianter