NK2 homeobox 1 - NK2 homeobox 1

NKX2-1
Identifikatorer
Aliaser	NKX2-1 , Nkx2-1, AV026640, Nkx2.1, T/EBP, Titf1, Ttf-1, BCH, BHC, NK-2, NKX2A, TEBP, TTF1, NMTC1, NK2 homeobox 1
Eksterne ID -er	OMIM : 600635 MGI : 108067 HomoloGene : 2488 GeneCards : NKX2-1
Genplassering ( menneske )
Chr.	Kromosom 14 (menneske)
Slutt	36 521 149 bp
Genplassering ( mus )
Chr.	Kromosom 12 (mus)
Slutt	56.536.908 bp
RNA-ekspresjon mønster
	; ;
	Flere referanseuttrykkdata
Genontologi
Molekylær funksjon	• DNA-bindende ; • sekvensspesifikk DNA-bindende ; • GO: 0001948 proteinbindende ; • enzym binding ; • RNA polymerase II transkripsjonen regulatorisk region sekvensspesifikk DNA-bindende ; • intron transkripsjonen regulatorisk region sekvensspesifikk DNA-bindende ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO : 0001130, GO: 0001204 DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet ; • transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II distal enhancer sekvensspesifikk binding ; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA-bindende transkripsjonsfaktoraktivitet, RNA-polymerase II-spesifikk ; • GO: 0000980 RNA-polymerase II cis-regulatorisk regionsekvens-spesifikk DNA-binding;
Mobil komponent	• nukleoplasma ; • kjerne ; • transkripsjonsregulatorkompleks;
Biologisk prosess	• regulering av transkripsjon, DNA-templat ; • rytmisk prosess ; • negativ regulering av transformerende vekstfaktor beta-reseptorsignalvei ; • transkripsjon, DNA-templat ; • positiv regulering av genuttrykk ; • negativ regulering av cellemigrasjon ; • respons på hormon ; • utvikling av forhjerne ; • epitelrør forgrening involvert i lungemorfogenese ; • negativ regulering av epitel til mesenkymal overgang ; • negativ regulering av transkripsjon ved RNA -polymerase II ; • nevronmigrasjon ; • regulering av transkripsjon av RNA -polymerase II ; • fosfolipid metabolsk prosess ; • mønsterspesifikasjonsprosess ; • aksonveiledning ; • hjerneutvikling ; • endodermutvikling ; • motorisk oppførsel ; • animalske organ morfogenese ; • telencefalon utvikling ; • globus pallidus utvikling ; • hippocampus utvikling ; • hjernebarken cellemigrering ; • forhjernen dorsal / ventral mønster dannelse ; • forhjernen neuron skjebne engasjement ; • forhjernen neuron differensiering ; • hjernebarken GABAergisk interneu rondifferensiering ; • cerebral cortex neuron differensiering ; • hypofyseutvikling ; • telencephalon cellemigrasjon ; • lungeutvikling ; • skjoldbruskkjertel utvikling ; • utviklingsinduksjon ; • Leydig celledifferensiering ; • positiv regulering av døgnrytme ; • negativ regulering av transkripsjon, DNA-templat ; • positiv regulering av transkripsjon, DNA-malbasert ; • positiv regulering av transkripsjon av RNA-polymerase II ; • anatomiske strukturdannelse er involvert i morfogenese ; • neuron skjebne engasjement ; • oligodendrocyttdifferensiering ; • lunge saccule utvikling ; • klubb celledifferensiering ; • type II pneumocytt differensiering ; • celledifferensiering;
	Kilder: Amigo / QuickGO
Ortologer
	7080
	21869
	ENSG00000136352
	ENSMUSG00000001496
	P43699
	P50220
	NM_001079668 ; NM_003317
	NM_001146198 ; NM_009385
	NP_001073136 ; NP_003308
	NP_033411
	Wikidata
Se/rediger Human	Se/rediger mus

NK2 homeobox 1 ( NKX2-1 ), også kjent som skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor 1 ( TTF-1 ), er et protein som hos mennesker er kodet av NKX2-1- genet .

Funksjon

Skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 (TTF-1) er et protein som regulerer transkripsjon av gener som er spesifikke for skjoldbruskkjertelen , lungen og diencephalon . Det er også kjent som skjoldbruskkjertelspesifikt forsterkerbindende protein. Det brukes i anatomisk patologi som en markør for å avgjøre om en svulst oppstår fra lungen eller skjoldbruskkjertelen. NKX2.1 kan induseres av activin A via SMAD2 -signalering i en human embryonisk stamcelledifferensieringsmodell.

NKX2.1 er nøkkelen til fosterutviklingen av lungestrukturer. Dorsal-ventralt mønster av NKX2.1-uttrykk danner den ventrale grensen i det fremre forut. NKX2.1 uttrykkes bare i utvalgte celler i den ventrale veggen i den fremre forut , og uttrykkes ikke i ryggveggen, der spiserøret vil komme fra. NKX2.1 knockout hos mus resulterer i utvikling av en forkortet luftrør som er smeltet til spiserøret, med bronkiene som direkte kobler dette delte røret til lungene. Dette ligner en komplett trakeoesofageal fistel , som er en sjelden medfødt tilstand hos mennesker. Videre utvikler ikke distale lungestrukturer seg i disse knockout -musene. Forgrening av lungene i disse musene skjedde ikke forbi hovedstammen bronkiene, noe som resulterte i lunger som var mindre i størrelse med omtrent 50% sammenlignet med villtypemusene . Den epiteliale foring av disse distale strukturene viste ikke tegn til differensiering til spesialiserte celler. Denne foringen består av søyleepitelceller og spredte ciliated epitelceller. Det proksimale epitelet i lungene viste normal differensiering, noe som indikerer at proksimal differensiering er uavhengig av NXK2.1. NKX2.1 kommer først til uttrykk i hele epitelet, men undertrykkes i et proksimal-distalt mønster etter hvert som lungen fortsetter å utvikle seg.

Klinisk signifikans

Mikrograf av et metastatisk lungeadenokarsinom (funnet i hjernen) som viser kjernefarging (brun) for TTF-1 .

TTF-1-positive celler er funnet i lungene som type II pneumocytes og klubb celler . I skjoldbruskkjertelen er follikulære og parafollikulære celler også positive for TTF-1.

For lungekreft er adenokarsinomer vanligvis positive, mens plateepitelkarsinomer og store cellekarsinomer sjelden er positive. Småcellekarsinomer (av alle primære steder) er vanligvis positive. TTF1 er mer enn bare en klinisk markør for lungeadenokarsinom. Den spiller en aktiv rolle i å opprettholde lungekreftceller med tanke på den eksperimentelle observasjonen at den er mutert i lungekreft.

Det har blitt observert at et tap av Nkx2-1 tillater deregulering av transkripsjonsfaktorer FOXA1/2 (ved å slappe av histondeacetylering og metyleringsmediert undertrykkelse av Foxa1/2 ved Nkx2-1) som forårsaker reaktivering av et embryonisk gastrisk differensieringsprogram i lungeceller . Dette resulterer i slimete lunge -adenokarsinom , en kilde til dårlige kliniske utfall for pasienter.

Andre har imidlertid funnet ut at TTF-1-farging ofte er positiv ved lungeadenokarsinomer, store cellekarsinomer, småcellet lungekarsinom, andre nevroendokrine svulster enn småcellet lungekarsinom og ekstrapulmonale småcellet karsinom.

Det er også positivt ved kreft i skjoldbruskkjertelen og brukes til å overvåke metastaser og tilbakefall.

Interaksjoner

NK2 homeobox 1 har vist seg å samhandle med Calreticulin og PAX8 .

Referanser

Videre lesning

Lau SK, Luthringer DJ, Eisen RN (juni 2002). "Skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1: en anmeldelse". Anvendt immunhistokjemi og molekylær morfologi . 10 (2): 97–102. doi : 10.1097/00022744-200206000-00001 . PMID 12051643 .
Guazzi S, Price M, De Felice M, Damante G, Mattei MG, Di Lauro R (november 1990). "Skjoldbrusk-kjernefaktor 1 (TTF-1) inneholder et homodomene og viser en ny DNA-bindingsspesifisitet" . EMBO Journal . 9 (11): 3631–9. doi : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07574.x . PMC 552115 . PMID 1976511 .
Oguchi H, Pan YT, Kimura S (april 1995). "Den komplette nukleotidsekvensen til musets skjoldbruskkjertelspesifikke enhancer-binding protein (T/EBP) -gen: omfattende identitet av den utledede aminosyresekvensen med det humane proteinet". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur og uttrykk . 1261 (2): 304–6. doi : 10.1016/0167-4781 (95) 00033-D . PMID 7711079 .
Saiardi A, Tassi V, De Filippis V, Civitareale D (april 1995). "Kloning og sekvensanalyse av transkripsjonsfaktor 1 for menneskelig skjoldbruskkjertel". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur og uttrykk . 1261 (2): 307–10. doi : 10.1016/0167-4781 (95) 00034-E . PMID 7711080 .
Ikeda K, Clark JC, Shaw-White JR, Stahlman MT, Boutell CJ, Whitsett JA (april 1995). "Genstruktur og uttrykk for menneskelig skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 i respiratoriske epitelceller" . Journal of Biological Chemistry . 270 (14): 8108–14. doi : 10.1074/jbc.270.44.26460 . PMID 7713914 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (september 1996). "Normalisering og subtraksjon: to tilnærminger for å lette genoppdagelse" . Genomforskning . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Ghaffari M, Zeng X, Whitsett JA, Yan C (desember 1997). "Nukleær lokaliseringsdomene for skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 i respiratoriske epitelceller" . The Biochemical Journal . 328 (Pt 3) (3): 757–61. doi : 10.1042/bj3280757 . PMC 1218983 . PMID 9396717 .
Hamdan H, Liu H, Li C, Jones C, Lee M, deLemos R, Minoo P (mars 1998). "Struktur av det humane Nkx2.1 -genet". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur og uttrykk . 1396 (3): 336–48. doi : 10.1016/S0167-4781 (97) 00210-8 . PMID 9545595 .
Perrone L, Tell G, Di Lauro R (februar 1999). "Calreticulin forbedrer transkripsjonsaktiviteten til skjoldbruskkjertelen transkripsjonsfaktor-1 ved å binde seg til hjemmets domene" . Journal of Biological Chemistry . 274 (8): 4640–5. doi : 10.1074/jbc.274.8.4640 . PMID 9988700 .
Naltner A, Ghaffari M, Whitsett JA, Yan C (januar 2000). "Stimulering av retinsyre av den humane overflateaktive protein B-promotoren er skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor 1-stedavhengig" . Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 56–62. doi : 10.1074/jbc.275.1.56 . PMID 10617585 .
Missero C, Pirro MT, Di Lauro R (april 2000). "Flere ras nedstrømsveier formidler funksjonell undertrykkelse av homeobox-genproduktet TTF-1" . Molekylær og mobilbiologi . 20 (8): 2783–93. doi : 10.1128/MCB.20.8.2783-2793.2000 . PMC 85494 . PMID 10733581 .
Naltner A, Wert S, Whitsett JA, Yan C (desember 2000). "Temporal/romlig uttrykk for atomreseptorkoaktivatorer i muselungen". American Journal of Physiology. Lungecellulær og molekylær fysiologi . 279 (6): L1066-74. doi : 10.1152/ajplung.2000.279.6.l1066 . PMID 11076796 . S2CID 27872061 .
Yan C, Naltner A, Conkright J, Ghaffari M (juni 2001). "Protein-protein-interaksjon mellom retinsyre-reseptor alfa og skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 i respiratoriske epitelceller" . Journal of Biological Chemistry . 276 (24): 21686–91. doi : 10.1074/jbc.M011378200 . PMID 11274148 .
Missero C, Pirro MT, Simeone S, Pischetola M, Di Lauro R (september 2001). "DNA-glykosylase T: G-mismatch-spesifikk tymin-DNA-glykosylase undertrykker skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1-aktivert transkripsjon" . Journal of Biological Chemistry . 276 (36): 33569–75. doi : 10.1074/jbc.M104963200 . PMID 11438542 .
Yi M, Tong GX, Murry B, Mendelson CR (januar 2002). "Rollen til CBP/p300 og SRC-1 i transkripsjonell regulering av det pulmonale overflateaktive protein-A (SP-A) genet av skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 (TTF-1)" . Journal of Biological Chemistry . 277 (4): 2997–3005. doi : 10.1074/jbc.M109793200 . PMID 11713256 .
Liu C, Glasser SW, Wan H, Whitsett JA (februar 2002). "GATA-6 og skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 samhandler og regulerer direkte ekspresjon av overflateaktivt protein-C-gen" . Journal of Biological Chemistry . 277 (6): 4519–25. doi : 10.1074/jbc.M107585200 . PMID 11733512 .
Ng WK, Chow JC, Ng PK (februar 2002). "Skjoldbrusk-transkripsjonsfaktor-1 er svært sensitiv og spesifikk når det gjelder å differensiere metastatisk lungekreft fra ekstrapulmonal adenokarsinom i effusjonsvæske-cytologi-prøver". Kreft . 96 (1): 43–8. doi : 10.1002/cncr.10310 . PMID 11836702 .
Pohlenz J, Dumitrescu A, Zundel D, Martiné U, Schönberger W, Koo E, et al. (Februar 2002). "Delvis mangel på skjoldbrusk -transkripsjonsfaktor 1 gir hovedsakelig nevrologiske defekter hos mennesker og mus" . Journal of Clinical Investigation . 109 (4): 469–73. doi : 10.1172/JCI14192 . PMC 150877 . PMID 11854318 .
Krude H, Schütz B, Biebermann H, von Moers A, Schnabel D, Neitzel H, et al. (Februar 2002). "Koreoatetose, hypotyreose og lungeforandringer på grunn av human NKX2-1 haploinsuffisiens" . Journal of Clinical Investigation . 109 (4): 475–80. doi : 10.1172/JCI14341 . PMC 150790 . PMID 11854319 .
Miccadei S, De Leo R, Zammarchi E, Natali PG, Civitareale D (april 2002). "Den synergistiske aktiviteten til skjoldbruskkjerteltransskripsjonsfaktor 1 og Pax 8 er avhengig av promotoren/forsterker -samspillet" . Molekylær endokrinologi . 16 (4): 837–46. doi : 10.1210/me.16.4.837 . PMID 11923479 .

Eksterne linker

TITF1+protein,+menneske ved US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

Denne artikkelen inneholder tekst fra United States National Library of Medicine , som er i offentlig regi .

Languages

In other projects